Полимеразная цепная реакция пцр гепатит в
3 апреля 2019772,6 тыс.
Полимеразная цепная реакция известна уже 30 лет. Ее широко используют во многих областях, начиная с археологии и заканчивая генетикой.
Именно метод пцр помогает установить отцовство, но наиболее часто его используют для выявления различных инфекционных болезней в организме человека.
Как проводят анализ методом пцр, и что это такое? На эти вопросы мы постараемся детально ответить.
Анализ ПЦР — что это такое?
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – высокоточный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет выявить у человека различные инфекционные и наследственные заболевания, как в острой и хронической стадии, так и задолго до того, как заболевание может себя проявить.
Метод ПЦР — абсолютно специфичен и выполненный правильно не может дать ложноположительный результат. То есть, если инфекции нет, то анализ никогда не покажет, что она есть. Поэтому сейчас очень часто для утверждения диагноза дополнительно сдают анализ ПЦР, чтобы определить возбудителя и его природу.
Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) в 1983 году разработал Кэри Мюллис (США), за что в 1993 году он удостоен Нобелевской премии в области химии.
В чем преимущество данного метода?
Диагностика этим методом позволяет найти возбудителя непосредственно в гене, который содержится в исследуемых материалах. Это самый точный анализ на половые инфекции, скрытые инфекции, различные венерические заболевания.
Отличия ПЦР-диагностики от других методов лабораторного исследования заключаются в следующем:
- метод нацелен на выявление самого возбудителя;
- диагностика методом ПЦР отличается универсальностью: для обнаружения возбудителей нескольких;
- заболеваний достаточно только одного биологического образца больного;
- метод обладает высокой чувствительностью и не сопровождается другими перекрестными реакциями.
Кроме этого, преимуществом ПЦР-диагностики является то, что для анализа пригоден любой биологический материал пациента: кровь, выделения из половых органов, моча, сперма.
Какие инфекции позволяет выявить мазок на ПЦР?
В организме может присутствовать большое количество возбудителей инфекций, сюда относятся и «скрытые», которые длительное время никак себя не проявляют.
Анализ мазка на ПЦР позволяет выявить такие инфекции:
- гепатит;
- уреплазмоз половых органов;
- кандидоз (молочница);
- хламидиоз половых путей;
- папиллома вирусная инфекция;
- герпес;
- наличие раковых клеток;
- микоплазмоз;
- бактериальный вагиноз;
- инфекционный мононуклеоз;
- трихомониаз;
- оценить гормональное состояние;
- СПИД (ВИЧ).
Исследуемым материалом для ПЦР обычно являются мокрота, слюна, моча, кровь. Перед проведением анализа необходимо тщательно подготовиться к нему, получив предварительную консультацию у врача.
Кровь для ПЦР обычно сдается натощак. Хорошие результаты показывает проведение анализа, когда материал для исследования взят из цервикального канала или уретры. В этом случае лучше всего провести ПЦР-диагностику не позже, чем через сутки после полового акта.
Разновидности ПЦР
ПЦР используется во многих областях для проведения анализов и в научных экспериментах. Существуют разные методики проведения анализа:
- ПЦР с обратной транскрипцией (Reverse Transcription PCR, RT-PCR (англ.)) — используется для амплификации, выделения или идентификации известной последовательности из библиотеки РНК.
- Инвертированная ПЦР (Inverse PCR (англ.)) — используется в том случае, если известен лишь небольшой участок внутри нужной последовательности. Этот метод особенно полезен, когда нужно определить соседние последовательности после вставки ДНК в геном.
- Вложенная ПЦР (Nested PCR (англ.)) — применяется для уменьшения числа побочных продуктов реакции. Используют две пары праймеров и проводят две последовательные реакции.
- Асимметричная ПЦР (англ. Asymmetric PCR) — проводится тогда, когда нужно амплифицировать преимущественно одну из цепей исходной ДНК. Используется в некоторых методиках секвенирования и гибридизационного анализа.
- Количественная ПЦР (Quantitative PCR, Q-PCR (англ.)) или ПЦР в реальном времени — используется для непосредственного наблюдения за измерением количества конкретного ПЦР продукта в каждом цикле реакции.
- Ступенчатая ПЦР (Touchdown PCR (англ.)) — с помощью этого подхода уменьшают влияние неспецифического связывания праймеров.
- Групп-специфическая ПЦР (англ. group-specific PCR) — ПЦР для родственных последовательностях внутри одного или между разными видами, используя консервативные праймеры к этим последовательностям.
Если нуклеотидная последовательность матрицы известна частично или неизвестна вовсе, можно использовать вырожденные праймеры, последовательность которых содержит вырожденные позиции, в которых могут располагаться любые основания. Например, последовательность праймера может быть такой: …ATH…, где Н — А, Т или С.
Какие биологические материалы исследуются?
Материалом для ПЦР-исследования, в котором можно выявить чужеродную ДНК бактерии или ДНК или РНК вируса могут служить различные биологические среды и жидкости человека:
- Моча. Может использоваться при инфекционном поражении мочеполового тракта у мужчин и мочевыделительных органов у женщин (у мужчин использование в качестве материала мочи заменяет эпителиальный соскоб).
- Мокрота. Применяется для диагностики туберкулеза и реже для диагностики респираторных форм хламидиоза и микоплазмоза. Мокроту в количестве 15-20 мл собирают в стерильный (одноразовый) флакон.
- Биологические жидкости. Сок простаты, плевральная, спинномозговая, околоплодная, суставная жидкость, бронхоальвеолярный лаваж, слюна забираются по показаниям.
- Эпителиальные соскобы со слизистых оболочек. Обычно используются для диагностики заболеваний, передающихся половым путем (ЗППП), таких как гонорея, хламидиоз, микоплазмоз, уреаплазмоз, трихомониаз, гарднереллез, герпетическая и другие инфекции, поражающие слизистые оболочки.
- Биоптаты. Чаще всего используют биоптаты желудка и двенадцатиперстной кишки для выявления хеликобактерной инфекции.
- Кровь, плазма, сыворотка. Используются для ПЦР анализа вирусов гепатитов B, C, D, G, герпеса, ЦМВ, ВИЧ, исследования генов человека.
Как подготовиться к сдаче анализа?
Достоверность результата ПЦР напрямую зависит от правильности сдачи материала на обследование. Материал не должен быть загрязнен, иначе результат исследования не будет объективен. К наиболее важным рекомендациям перед сдачей анализа ПЦР относятся следующие требования:
- Моча сдается утром в стерильный контейнер.
- Анализ крови на инфекции необходимо сдавать на голодный желудок в утреннее время.
- Не стоит проявлять половую активность за сутки до проведения анализа.
Результат анализа будет готов через 1,5-2 суток после проведения рассматриваемой процедуры. Встречаются такие ситуации, когда результат может быть подготовлен в тот же день.
Расшифровка анализа ПРЦ
Процесс интерпретации представленного исследования отличается своей простотой. Результаты пцр анализа можно получить через 1,5-2х суток после сдачи материала. В некоторых случаях результат готов в первый же день, и вот что они могут означать:
- Отрицательный результат показывает, что в диагностируемом материале отсутствует искомый инфекционный возбудитель.
- Пцр положительный обозначает, что в организме человека присутствует ДНК или РНК возбудителя.
В некоторых случаях производят количественное определение микроорганизмов. Это особенно актуально при заболеваниях, вызванных условно-патогенными микроорганизмами. Так как данные бактерии проявляют свое негативное воздействие лишь при избыточном количестве.
Также количественный анализ ПЦР важен для выбора терапевтической тактики и с целью контроля над лечением таких вирусных инфекций, как ВИЧ и вирусы гепатита.
Насколько точна ПЦР диагностика инфекций?
Метод ПЦР отличается высокой точностью, специфичностью и чувствительностью. Это означает, что данный анализ способен:
- точно определить наличие или отсутствие инфекции;
- точно указать, что именно это за инфекция (специфичность);
- обнаружить инфекцию даже при очень низком содержании ДНК микробов в биологическом материале,
- который был подвергнут исследованию (чувствительность).
ПЦР анализ: цена и сроки
Цена конкретного анализа будет зависеть от того, на какую инфекцию вы будете проверяться. Примерные цены и сроки:
- ИППП: 300-500 руб, сроки – 1 день;
- Вирус Эпштейна-Барра, вирус папилломы человека, герпеса, цитомегаловирус: 300-500 руб, сроки – 1 день;
- Гепатит A, B, C, D, G: качественный анализ 650 руб, количественный анализ 2000 руб. Сроки – до 5 дней;
- Антитела к вирусу гепатита С, суммарные ( Anti-HCV ) – 420 руб;
- Антитела к вирусу гепатита C, IgM ( Anti-HCV IgM ) – 420 руб;
- Хеликобактер пилори (Helicobacter pylori): 300-400 руб, сроки – 1 день;
- ВИЧ (антитела и антигены) – 380 руб;
- РНК ВИЧ, качественно – 3 500 руб;
- РНК ВИЧ, количественно – 11 000 руб.
Чтобы сэкономить средства, можно выбирать фиксированный пакет анализов. Такую услугу предоставляет большинство клиник где можно сдать анализ методом ПРЦ (инвитро, онклиник и т.д).
Источник
Вирусный гепатит В является серьезным и опасным заболеванием. Опасность этой болезни заключается в осложнениях, которые следуют за ее основными проявлениями. Поэтому очень важно не запустить болезнь, и своевременная диагностика поможет этого добиться.
Так как гепатит В в основном передается через зараженную кровь, основным методом диагностики этого заболевания является анализ этой биологической жидкости. В частности, это полимеразная цепная реакция (ПЦР). Но как применяется метод ПЦР при гепатите В? Что собой представляет этот анализ? Как правильно подготовиться к ПЦР-анализу на гепатит? Ответы вы найдете в статье.
Что это за анализ?
Полимеразная цепная реакция — это анализ крови, благодаря которому можно определить количество и концентрацию ДНК и РНК возбудителя. ПЦР позволяет своевременно диагностировать заболевание, нивелируя риск проявления серьезных последствий недуга. Для диагностики вирусного гепатита В берется небольшой образец венозной крови пациента.
Основными задачами ПЦР на гепатит В являются:
- Диагностика вирусного поражения печени на самом раннем этапе ее развития;
- Уточнение диагноза при спорных результатах других анализов;
- Выявление вирусоносительтва;
- Определение генотипа и квазитипа патогена.
Преимуществами данного вида диагностики являются высокий уровень достоверности и быстрое получение результатов. Различают количественный и качественный анализы ПЦР. Рассмотрим каждый из них подробнее.
Количественный ПЦР при гепатите В
Количественный ПЦР при гепатите С проводится для определения количества патогенного ДНК в плазме крови пациента. Определяемым фрагментом в данном случае становится уникальная ДНК-последовательность структурного вирусного белка.
Количественный ПЦР применяется не только для постановки диагноза. При лечении гепатита В при помощи данного анализа можно установить действенность терапии по вирусной нагрузке. Если она снижается, лечение можно считать успешным.
Расшифровка качественной полимеразной цепной реакции проводится в лабораторных условиях профильными медработниками. Ключевые показатели анализа представлены ниже:
- От 75 МЕ/мл до 108 МЕ/мл — положительный результат;
- Менее 75 МЕ/мл — отрицательный результат, возбудитель вирусного поражения печени не обнаружен.
Если результат анализа положительный, можно говорить об обнаружении патогена в организме носителя, а также о сопутствующей вирусной нагрузке. В этом случае пациенту может быть назначено определенное лечение. Наиболее эффективной является терапия с применением инновационных противовирусных средств. Однако в настоящее время ВГВ признан излечимым только частично.
Отрицательный ПЦР свидетельствует об отсутствии заражения возбудителем вируса гепатита В. Однако это не означает, что человек полностью здоров. Рекомендуется сдать анализы также и на другие типы гепатита. Особенно коварен гепатовирус типа С, который чаще всего провоцирует хроническую форму болезни без выраженной симптоматики. Поэтому заболевание важно своевременно диагностировать.
Качественный анализ ПЦР
Качественный анализ ПЦР при гепатите В нацелен на обнаружение патогена. Это — один из наиболее точных методов диагностики гепатовируса. Полимеразная цепная реакция на основе образцов венозной крови пациента проводится в режиме реального времени.
Показатель свыше 75,0 МЕ на мл свидетельствует о наличии возбудителя заболевания в организме больного. Это может быть как вирусоносительтво, так и активная фаза опасного заболевания.
В каких случаях показан ПЦР?
Метод ПЦР при гепатите В — наиболее рекомендуемый гепатологами способ проверить наличие вируса в крови. Пройти анализ на полимеразную цепную реакцию рекомендуется в следующих случаях:
- При наличии явных симптомов гепатита — тошноты, рвоты, желтушности склер и кожи, болей в области печени, обесцвечивания кала и потемнения мочи;
- При внутривенной (инъекционной) наркомании;
- При высоких показаниях АлТ и АсТ в результатах биохимического анализа крови;
- При холестазе (застое в желчевыводящих путях);
- Беременность или хирургическое вмешательство, предварительная подготовка к родам или операции;
- При регулярных процедурах диализа или переливания крови;
- Если состоялся половой акт с потенциально зараженным партнером.
Количественный или качественный анализ ПЦР также может назначаться лицам, которые в прошлом уже переболели одной из форм гепатита. Таким образом мониторится состояние пациента, так как возможен рецидив.
Как подготовиться?
Любая диагностика вирусного заболевания требует подготовки, в противном случае результаты будут неточными. Перед сдачей крови на ПЦР количественный при гепатите В, пациенту следует:
- Отказаться от тяжелой и насыщенной жирами пищи за сутки до явки на сдачу образца крови;
- Не есть в течение последних 8 часов перед сдачей анализа;
- Отказаться от употребления алкоголя и табачной продукции не менее чем за 1 сутки;
- Избегать стресса и физической перегрузки, хорошо выспаться.
Сбор образцов биологической жидкости для исследования проводится в утренние часы. Чаще всего анализ ПЦР на гепатит В сдается в 8 утра.
Оцените статью:
| Всего голосов: 0 Средняя оценка: 0
Источник
Полимеразная цепная реакция — это вид анализа крови, который позволяет безошибочно выявлять вирус гепатита В. Особенностью метода является то, что он способен показать ВГВ на ранних стадиях — уже через месяц после инфицирования, в то время как специфический антиген у больного обнаруживается только через 2 месяца. ПЦР может выявить не только обычный ДНК-вирус, но и мутантные штаммы, которые ни один другой анализ увидеть не позволяет.
При расшифровке ПЦР на гепатит В результаты сравниваются со стандартными значениями. На основе этого делаются выводы о наличии заболевания (положительный результат), концентрации вируса (активности) или отсутствии недуга (отрицательный результат). Обработка данных идет 2 недели.
Виды ПЦР на вирусный гепатит В
Существует 2 вида диагностики, которые назначают при гепатите В. Качественный ПЦР дает возможность с точностью в 100% сказать, есть ли ВГВ в крови или нет. Количественный ПЦР показывает активность вируса, то есть сколько ДНК фрагментов ВГВ содержится в 1 мл крови.
Качественный ПЦР и его трактовка
Проведение анализа крови на гепатит В методом ПЦР может выявить лишь наличие ДНК-фрагментов. Назначается в том случае, когда пациент подозревает о заражении ВГВ (HBV) или когда другие способы диагностики, например, серологические пробы не дают четкого ответа. Расшифровка результатов при проведении качественного анализа очень проста:
- отрицательный результат — вируса нет;
- положительный результат — вирус обнаружен.
Целью качественного ПЦР является подтверждение или опровержение наличия вируса гепатита В, а также проведение ранней диагностики. Если ВГВ выявлен в течение 1-2 недели после заражения, то лечение станет максимально эффективным. При активном развитии HBV в течение 2-х месяцев и выше, заболевание переходит в хроническую форму и полному излечению не подлежит.
В случае когда качественный ПЦР на гепатит показывает наличие вируса, следующим этапом становится проведение количественной диагностики.
Количественный ПЦР
Для назначение эффективного лечения или оценки результатов проводимой терапии просто знать, что у больного имеется ВГВ, недостаточно. Необходимо определить количественно значение ДНК вируса гепатита В в 1 мл крови, то есть вирусную нагрузку на организм. Этот вид ПЦР на гепатит В проводится в следующих случаях:
- Перед назначением лечения.
- Для оценки эффективности терапии.
- Для определения развития устойчивости вируса к принимаемым препаратам.
- Для определения стадии, на которой находится заболевание.
Единицей измерения вируса являются международные единицы (МЕ/мл) или количество копий ДНК/мл, то есть количество ДНК-фрагментов на 1 мл крови. Соотношение между двумя единицами зависит от выбранной тест системы и колеблется от 2 до 7 копий/мл в 1 МЕ/мл. Если система неизвестна, то для пересчета используется усредненное значение:
1 МЕ/мл = 5 копий/мл
Если сразу делается количественный анализ, то граничная норма для диагностирования заболевания составляет 75 МЕ/мл. При результате выше этого показателя, ставится диагноз ВГВ, ниже — ВГВ не выявлен.
Трактовка количественного ПЦР
При гепатите В нормами ПЦР выступают следующие значения вирусной нагрузки (виремии), копий/мл:
- < 10^3 — нагрузка очень низкая, вирус ведет себя неактивно;
- от 10^4 до 10^5 — нагрузка низкая, вирус обычно неактивен;
- 10^6 — нагрузка умеренная, вирус ведет себя активно;
- 10^7 — виремия большая, вирус высокоактивен.
Зная количественно, как ведет себя вирус в организме, можно определить форму заболевания (хроническая, острая или носительство), необходимость проведения дополнительных исследований, реакцию организма и вируса на лечение:
- Хронический гепатит В диагностируется, если значение трансаминазы будет выше нормы, активность вируса — больше 4, а концентрация ДНК-копий в миллилитре крови составит 10^5 копий.
- Носительство определяется по следующей картине, которую дают результаты — концентрация < 10^5 копий/мл, а уровень трансаминазы равен стандартному значению.
- Резистентность (устойчивость) при HBV постоянно контролируется во время лечения. Анализы сдаются каждые 3 месяца. Если в один из моментов виремия при гепатите увеличится в 10 раз, то это означает, что ВГВ приспособился к используемым лекарственным препаратам — стал устойчивым.
- Благоприятный ход лечения покажет снижение виремии на 85% через 3 дня после начала терапии.
- Направление на биопсию печени больной получает лишь тогда, когда показатель АЛТ (аланинаминотрансферазы) превышает нормальное значение не более 2 раз за 6 месяцев, а расшифровка ПЦР на гепатит В показывает виремию > 10^5 копий/мл. Когда же при большой вирусной активности наблюдается повышение уровня АЛТ чаще 2-х раза за полгода, то сразу же назначается антивирусная терапия.
Чтобы узнать, как будет вести себя ДНК гепатит в плане хронизации, то есть перехода к хронической форме из острой, также используются результаты ПЦР-диагностики:
- ДНК ВГВ < 2 х 10^4 копий/мл означает, что острая стадия не перейдет в хроническую форму;
- ДНК ВГВ лежит в пределах от 2 х 10^4 до 2 х 10^6 копий/мл означает, что у каждого 4-ого больного ВГВ станет хроническим, то есть хронизация составляет 25-30%;
- ДНК ВГВ > 2 х 10^6 копий/мл означает, что приобретение хронической формы недуга неизбежно.
Подготовка к обследованию
Для определения наличия ВГВ методом ПЦР делается анализ крови из вены. Процедура всегда проводится строго натощак и лучше всего попасть в лабораторию утром, когда естественное время отдыха от пищи составит 8 часов. Чтобы результаты обследования получились верными, необходимо узнать заранее, как подготовиться к походу в клинику правильно. Дополнительные этапы таковы:
- Отказ от жирной пищи, курения, спиртного и занятий спортом за 12 часов до процедуры.
- Отдых в течение 20 минут непосредственно перед сдачей крови.
- Перед началом процедуры необходимо предупредить медсестру о принимаемых медикаментах.
Внимание! Если диагностика проводится ребенку младше 5-ти лет, то за полчаса до процедуры его нужно поить кипяченой водой по 1 стакану через каждые 10 минут.
Подводя итоги
На сегодняшний день ПЦР-диагностика для выявления гепатита В является самым точным методом. Способ позволяет увидеть скрытые и мутировавшие формы заболевания, выявить недуг на первых неделях после инфицирования и, соответственно, провести эффективное лечение. В зависимости от ситуации проводится качественный или количественный ПЦР, которые направлены на выявление ВГВ и установлении его активности. Чтобы пройти обследование, нужно обратиться к вирусологу, инфекционисту или гепатологу.
Источник