Возбудители острых кишечных инфекций анализ

[09-134]
Острые кишечные инфекции, скрининг (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus)

1920 руб.

Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.

Синонимы русские

ОКИ, ПЦР (кал).

Синонимы английские

Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Кал.

Как правильно подготовиться к исследованию?

Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты). Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.

Согласно официальной статистике, в России до 65-67% заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.

Shigella species и Esherichia coli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии). Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев «бактериологически неподтвержденной дизентерии», особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.

Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и паратифа. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллез может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.

Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).

В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является «золотым стандартом» в клинической диагностике норовирусных инфекций.

Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНК-содержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.

Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.

Для чего используется исследование?

Для установления этиологического фактора острой кишечной инфекции;
для дифференциальной диагностики причин острого гастроэнтероколита (воспаления ЖКТ).

Когда назначается исследование?

При симптомах острого гастроэнтерита, вероятно, инфекционной этиологии (жидкий частый стул, рвота, лихорадка, боли в животе);
при одновременном или последовательном развитии ОКИ у нескольких членов семьи, у детей в детском учреждении или пациентов в стационаре;
при подозрении на развитие внутрибольничной кишечной инфекции (при обострении симптомов энтероколита у пациента, находящегося на лечении по поводу ОКИ).

Что означают результаты?

Референсные значения: отрицательно.

Причины положительного результата:

присутствие ДНК или РНК возбудителя ОКИ; этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus).

Причины отрицательного результата:

отсутствие инфицирования Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus.

Важные замечания

Рекомендуется проводить исследование в первые 3 суток с начала заболевания, у госпитализированных пациентов – в первый день госпитализации.
Важно помнить, что острый энтероколит может быть обусловлен и другими инфекциями (например, амебами, лямблиями, иерсиниями, клостридиями, протеями и др.) или неинфекционными причинами (токсинами, ядовитыми веществами, острой непроходимостью кишечника, тромбозом сосудов брыжейки, воспалительными заболеваниями кишечника, острым панкреатитом, аппендицитом, целиакией, острым гепатитом, мальабсорбцией, дивертикулитом).

Также рекомендуется

Yersinia pseudotuberculosis, ДНК [ПЦР]
anti-Shigella flexneri 1-5, anti-Shigella flexneri 6, anti-Shigella sonnei
Посев кала на патогенную флору (диз. группа и тифо-паратифозная группа)
Посев кала на условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам
Анализ кала на цисты простейших
Копрограмма
Общий анализ крови (без лейкоцитарной формулы и СОЭ)
Лейкоцитарная формула
Скорость оседания эритроцитов (СОЭ)

Кто назначает исследование?

Инфекционист, гастроэнтеролог, терапевт, педиатр.

Литература

Борисов Л. Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. М.: МИА, 2005. – 736 с.
Gómez-Duarte O., Bai J., Newel E. Detection of E. coli, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae, and Campylobacter spp. enteropathogens by Three-reaction Multiplex PCR. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009 January; 63(1): 1-9. PMCID: PMC2701628.

Источник

Острые кишечные инфекции — это группа заболеваний (около 30), для которых характерно поражение желудочно-кишечного тракта. Кишечные инфекции широко распространены в мире. По частоте распространения среди всех болезней человека кишечные инфекций уступают лишь респираторным заболеваниям. Более 60% всех случаев кишечной инфекций встречается у детей. Каждый год от кишечных инфекций в мире умирает около 1 млн. детей (большая часть в возрасте до 2 лет). Ведущим симптомом (который ведет к тяжелым последствиям) кишечных инфекций является сильный понос (диарея). Если раньше кишечные инфекции чаще диагностировались только в летом, то в настоящее время из-за выраженной миграции людей могут встречаться в любое время года. Причиной развития острых кишечных инфекций могут быть бактерии (сальмонелла, шигеллы, стафилококк, эшерихии, иерсинии, кампилобактер и др.), а также вирусы (энтеровирус, ротавирус). Возбудители бактериальных кишечных инфекций вырабатывают энтеротоксин (яд), который, попадая в кишечник, вызывает отравление организма человека.

Пищевые отравления стафилококком. Стафилококковые пищевые отравления входят в большую группу кишечных инфекций, которые возникают в результате употребления в пищу пищевых продуктов, зараженных микробом (стафилококком). Источники стафилококковой инфекции это больные ангиной, фарингитом, тонзиллитом или люди с гнойными поражениями кожи. Как правило, отравление стафилококком происходит при употреблении следующих продуктов питания: молоко, кефир, рыба, мясо. Необходимым условием для возникновения стафилококковой кишечной инфекции является нарушение правил приготовления и хранения пищи. Первые признаки и симптомы пищевого отравления стафилококком появляются уже спустя 5-8 часов после употребления в пищу зараженных продуктов.

Сальмонеллез — это острая кишечная инфекция, возбудителем которой являются бактерии из рода сальмонелл. Известны более 1500-2000 видов сальмонелл, которые могут быть причиной желудочно-кишечных инфекции у людей. Основной причиной развития сальмонеллеза является нарушение правил обработки и хранения пищи. Инкубационный период при сальмонеллезе составляет от 5-7 часов до 3 суток. Основным источником инфекции для людей являются животные (крупный рогатый скот, лошади, свиньи, кошки, собаки, птицы и т.д.). Иногда сальмонеллы встречаются в яйцах домашней птицы. Как правило, сальмонеллез возникает в результате употребления плохо приготовленных мяса или яиц зараженных сальмонеллами. Иногда причиной сальмонеллеза является больной человека или бактерионоситель (носитель сальмонелл).

Дизентерия (или шигеллез) относится к группе острых кишечных инфекций – заболеваниям с фекально-оральным механизмом передачи, которые характеризуются симптомами общей интоксикации и диареей. Возбудителем дизентерии является бактерии рода Shigella , поэтому и само заболевание называется «шигеллез». Название «дизентерия» образовалось из двух слов греческого происхождения – «dys» (нарушение) и «enteron» (кишечник). Шигеллы распространены повсеместно. Выделяют 4 вида этой бактерии, каждый из которых способен вызывать дизентерию у человека: Shigella dysenteriae, Shigella flexneri , Shigella boydii и Shigella sonnei. Заражение происходит следующим образом: бактерии из кишечника больного человека попадают в желудочно-кишечный тракт здорового человека. Это может произойти через грязные руки, при попадании бактерий в пищевые продукты, воду, через насекомых. Кроме того, заражение возможно при купании в загрязненных водоемах.

Эшерихиоз – острая кишечная инфекция, вызываемая некоторыми типами кишечных палочек, протекающая с синдромом гастроэнтерита и гастроэнтероколита. Реже эшерихиоз протекает с внекишечной локализацией как генерализованная форма болезни. E. coli имеют сложную антигенную структуру. Основными источниками инфекции являются больные (чаще стертой формой заболевания); меньшее значение имеют бактерионосители. Механизм передачи – фекально-оральный. Реализация его происходит разными путями: пищевым, водным и бытовым. 80 % случаев эшерихиоза имели пищевой путь заражения, особенно через молоко и молочные продукты.

Ротовирусная кишечная инфекция — это заболевание, принадлежащее к группе кишечных инфекций, возбудителем которого является ротавирус. Источником ротавирусной кишечной инфекция является сам больной человек, в котором размножается микроорганизм или же носитель данного вируса. Механизм передачи инфекции от человека к человеку фекально-оральный, то есть в основном причина — немытые руки после посещения туалета, уборки фекалий за домашними животными или же попадание частичек на предметы обихода вследствие не соблюдения элементарных правил гигиены.

Наряду с дизентерией и сальмонеллезом кампилобактериоз является одной из основных острых кишечных инфекций. Ее признаки и течение сходны с признаками и течением дизентерии. Возбудителя кампилобактериоза распространяют животные и птицы: дикие, сельскохозяйственные (куры, крупный рогатый скот и др.) и домашние (кошки, собаки). У многих из них этот микроб живет в желудочно-кишечном тракте, не вызывая заболевания. Возбудитель передается при употреблении загрязненных продуктов питания или воды. Наиболее часто заражение происходит при недостаточно долгой термической обработке домашней птицы. Кампилобактериоз возникает также после употребления непастеризованного или некипяченого молока, контакта с зараженным животным.

Кишечный иерсиниоз – острая инфекционная болезнь, с фекально-оральным механизмом передачи инфекции. Поражает желудочно-кишечный тракт, печень, опорно-двигательный аппарат и другие органы. Встречается повсеместно. Иерсинии весьма неприхотливы к питательным веществам и поэтому растут в кипяченой, водопроводной и стерильной дистиллированной воде. Хранение продуктов в холодильнике не является гарантией безопасности от инфекции! Достаточно долго иерсинии выживают на различных продуктах питания и даже могут на них размножаться, например, на овощах (морковь, капуста, зеленый и репчатый лук), особенно приготовленных в виде салатов. В молоке иерсинии сохраняются до 18 суток, на хлебе, кондитерских изделиях — от 16 до 24 суток. Больной кишечным иерсиниозом или носитель при определенных условиях может явиться источником инфекции для окружающих.

Для диагностики и лечения вышеперечисленных заболеваний необходимо провести ряд лабораторных исследований, таких как:

посев кала на возбудителей кишечной группы (код по бланку 22.1.),

посев кала на микрофлору с а/б чувствительностью (код по бланку 22.60.),

посев на золотистый стафилококк с а/б и фагочувствительностью (код по бланку 22.23.),

посев на кишечную палочку с а/чувствительностью (код по бланку 22.47.),

посев на кампилобактер с а/чувствительностью (код по бланку 22.28.),

посев на иерсинии с а/чувствительностью (код по бланку 22.50.),

кал на ротавирусы (код по бланку 21.8.).

Лечение кишечных инфекций необходимо проводить под контролем врача, чтобы избежать формирования бактерио- или вирусоносительства. ООО «Лаборатория Гемотест» может помочь в своевременной ранней диагностике острых кишечных инфекций.

Авторы:

Заведующая отделом общеклинических исследований КДЛ ООО «Лаборатория Гемотест» Дубровская Г.Е.

Заведующая отделом бактериологии ООО «Лаборатория Гемотест» Прима Е.Д.

Вернуться

Источник

17 декабря. 2019

Обычно анализ на кишечные инфекции проводят при необходимости установить наличие патогенных бактерий в кишечнике или желудке. Именно серологическое исследование и микробиологическое лежат в основе точного определения заболеваний бактериального характера. Благодаря обследованию можно обнаружить микробов, а также определить, какое лекарство будет эффективно. Тест позволяет расшифровать причину возникновения инфекций. Наш кишечник населен хорошими бактериями и условно-патогенной флорой. Если в организм попадают патогенные микробы, либо вирусы, формируется заболевание.

Если произошло снижение иммунитета, то условно-патогенная флора начинает активно размножаться в организме. Среди причин заболеваний также можно отметить:

зараженная вода;
недостаточно промытая зелень;
отсутствие хорошей термической обработки определенных продуктов;
немытые руки;
общение с больным человеком;
заболевшее животное.

Анализ на кишечные инфекции

Определенные тесты назначают, когда сложно поставить диагноз. Многие болезни имеют схожие признаки. Чтобы быть уверенными в точности результата, приходите в наш медицинский центр. Мы проведем диагностику и в кратчайшие сроки выдадим результат. Вы можете прийти в удобное время, при необходимости наши опытные специалисты расшифруют все показатели и назначат грамотное лечение.

Вам не придется столкнуться с большими очередями и мучительным ожиданием. Вы можете связаться с менеджером и уточнить все детали, включая время, в которое можно прийти и провести диагностику. В нашей частной поликлинике пациентам четко разъясняют все показатели теста. И при желании вы можете на месте получить в тот же день консультацию врача.

Для обследования обычно берут:

кал;
кровь.

Когда назначают исследование на носительство возбудителей кишечных инфекций?

Обычно анализ назначается при определенной симптоматике, чтобы подтвердить, либо опровергнуть подозрения и назначить лечение, если болезнь выявлена. Тестирование назначается в случаях, когда:

появилась рвота и диарея;
при поступлении в больницу;
произошел контакт с больным;
чтобы понять, эффективно ли лечение;
проводятся периодические медосмотры.

Забор биоматериала осуществляется на дому или в больнице. Непременно исследование проходить должны:

сотрудники медучреждений;
лица, которые работают на предприятиях, связанных с приготовлением еды;
воспитатели и другие работники детского сада.

Все вышеперечисленные категории должны обследоваться 1 раз в год. Крайне важны такие мероприятия для исключения вспышек инфекции, наиболее легко распространяющейся в детском саду. При скученности коллектива заболевания передаются очень быстро.

Исследование кала на кишечные инфекции

Нельзя не подчеркнуть, что тест на выявление опасной флоры осуществляется серологическим способом, а также микробиологическим или бактериологическим. Для начала проводится микроскопия. Возбудитель в конкретном препарате оценивается под микроскопом. Но подобный метод целесообразен только через пару дней от момента начала болезни.

Уже после того, как лаборанты получают данные микроскопии, они решают, какую выбрать среду, чтобы в нее посеять материал. В особых чашках подготовлены условия для размножение микробов. Через некоторое время определяются морфологические свойства. Многих пациентов интересует вопрос, нужно ли заранее как-то готовиться к диагностике. Необходимо исключить:

слабительные препараты;
энтеросорбенты;
препараты железа;
антибиотики.

Врачи рекомендуют воздержаться от использования лекарств в течение недели до сдачи анализа. Для сбора каловых масс подойдет только одноразовая емкость. Для удобства были продуманы контейнеры с небольшой ложечкой, которой удобно набирать материал. Подойдет и простая баночка, она должна предварительно кипятиться.

Лучше всего массы собирать с утра и сразу доставить их в лабораторию. Перед забором кала запрещено прибегать к клизмам, иначе результат окажется ложным. Врачи разрешают хранить тару в холодильнике, но не в морозильной камере.

Помните, что своевременное выявление недуга позволяет упростить лечение. Именно поэтому стоит проходить обследование профилактически, даже если жалобы отсутствуют. Целью исследования является выявление болезней у детей и взрослых, страдающих от поноса, либо лиц, которые находятся в очагах заболеваемости. Повторный тест проводится через 14 дней после завершения антибактериальной терапии.

Готовится анализ не менее 5 суток. В нем могут обнаружиться шигеллы или сальмонеллы, стафилококк, клебсиелы и протей. Когда определяется резистентность, то возле каждого из видов указывают антибиотик, а также чувствительность к нему в плюсах. Большое число плюсов указывает, что препарат хорошо действует.

ПЦР диагностика

Ученые разработали особую методику выявления кишечных инфекций, которая получила название ПЦР. Она применяется весьма успешно. Метод позволяет быстро поставить диагноз. Даже в небольшом количестве биоматериала легко обнаруживается ДНК возбудителя. Собирается совершенно любая из жидкостей.

Исследование крови

Для уточнения всех данных и определения присутствия инфекции проводится общий анализ крови и серологический. Кровь очень быстро реагирует на все происходящие в организме неполадки. При наличии любой инфекции повышается уровень лейкоцитов и СОЭ.

Серология — это достаточно информативный метод, который демонстрирует количество антител. На любой процесс, который является патологическим, организм реагирует выработкой антител. Проверяется зачастую уровень двух иммуноглобулинов — G и М. Самым первым будет реагировать иммуноглобулин, относящийся к классу М. Он указывает на острое течение болезни. Его уровень резко снижается через неделю от начала заболевания. Но в этот период растет титр G. Он указывает на то, что инфекция была перенесена когда-либо .

Во избежание заражения всевозможными инфекциями, поражающими кишечник, важно тщательно мыть руки, хорошо промывать овощи, фрукты и зелень, избегать контакта с большим числом людей. Не стоит забывать, что способен передаваться возбудитель даже через чихание.

Опасная флора хорошо размножается в теплой и влажной среде. Но главными источниками опасности служат больные люди и животные. Часто происходит заражение в странах третьего мира, где антисанитария. Опасно пить родниковую воду, покупать лопнувшие фрукты, пить сырое молоко, заглатывать воду в водоемах. Если заболел ребенок или пожилой человек, к врачу надо обращаться незамедлительно при первых признаках, так как для этих категорий лиц острые инфекции опасны быстрым обезвоживанием и нередко приводят к гибели.

При малейших подозрениях на недуг обращайтесь в наш центр. Мы проведем полную диагностику, а затем грамотный специалист назначит терапию. Дети до 3 лет всегда подлежат госпитализации при тяжелой инфекции. Не занимайтесь самолечением. Помните, что вовремя поставленный диагноз помогает избежать тяжелых осложнений и во многих случая спасает жизнь. При необходимости у нас можно пройти обследование для санитарной книжки или профосмотр. Наша клиника всегда к вашим услугам и готова предоставить квалифицированную помощь и грамотный подход.

Источник