Кишечная инфекция экспресс метод

[09-134]
Острые кишечные инфекции, скрининг (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus)

1920 руб.

Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.

Синонимы русские

ОКИ, ПЦР (кал).

Синонимы английские

Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Кал.

Как правильно подготовиться к исследованию?

  • Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
  • Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты). Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.

Согласно официальной статистике, в России до 65-67% заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.

Shigella species и Esherichia coli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии). Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев «бактериологически неподтвержденной дизентерии», особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.

Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и паратифа. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллез может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.

Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).

В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является «золотым стандартом» в клинической диагностике норовирусных инфекций.

Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНК-содержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.

Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.

Для чего используется исследование?

  • Для установления этиологического фактора острой кишечной инфекции;
  • для дифференциальной диагностики причин острого гастроэнтероколита (воспаления ЖКТ).

Когда назначается исследование?

  • При симптомах острого гастроэнтерита, вероятно, инфекционной этиологии (жидкий частый стул, рвота, лихорадка, боли в животе);
  • при одновременном или последовательном развитии ОКИ у нескольких членов семьи, у детей в детском учреждении или пациентов в стационаре;
  • при подозрении на развитие внутрибольничной кишечной инфекции (при обострении симптомов энтероколита у пациента, находящегося на лечении по поводу ОКИ).

Что означают результаты?

Референсные значения: отрицательно.

Причины положительного результата:

  • присутствие ДНК или РНК возбудителя ОКИ; этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus).
Читайте также:  Кишечная инфекция что пить ребенку

Причины отрицательного результата:

  • отсутствие инфицирования Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus (2-й генотип), Astrovirus.



Важные замечания

  • Рекомендуется проводить исследование в первые 3 суток с начала заболевания, у госпитализированных пациентов – в первый день госпитализации.
  • Важно помнить, что острый энтероколит может быть обусловлен и другими инфекциями (например, амебами, лямблиями, иерсиниями, клостридиями, протеями и др.) или неинфекционными причинами (токсинами, ядовитыми веществами, острой непроходимостью кишечника, тромбозом сосудов брыжейки, воспалительными заболеваниями кишечника, острым панкреатитом, аппендицитом, целиакией, острым гепатитом, мальабсорбцией, дивертикулитом).

Также рекомендуется

  • Yersinia pseudotuberculosis, ДНК [ПЦР]
  • anti-Shigella flexneri 1-5, anti-Shigella flexneri 6, anti-Shigella sonnei
  • Посев кала на патогенную флору (диз. группа и тифо-паратифозная группа)
  • Посев кала на условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам
  • Анализ кала на цисты простейших
  • Копрограмма
  • Общий анализ крови (без лейкоцитарной формулы и СОЭ)
  • Лейкоцитарная формула
  • Скорость оседания эритроцитов (СОЭ)

Кто назначает исследование?

Инфекционист, гастроэнтеролог, терапевт, педиатр.

Литература

  • Борисов Л. Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. М.: МИА, 2005. – 736 с.
  • Gómez-Duarte O., Bai J., Newel E. Detection of E. coli, Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae, and Campylobacter spp. enteropathogens by Three-reaction Multiplex PCR. Diagn Microbiol Infect Dis. 2009 January; 63(1): 1-9. PMCID: PMC2701628.

Источник

На сегодняшний день многие люди не понаслышке знакомы с тем, что такое анализ кала на кишечные инфекции. Все потому, что множество заболеваний протекает с подобными друг к другу симптомами, а поэтому диагностировать их можно, лишь сдав анализ на кишечные инфекции.

Особенности инфекционного заболевания

Кишечник человека является совершенно специфическим органом. В нем развивается множество бактерий, которые можно отнести к нормальной микрофлоре.

Некоторые бактерии не приносят никакого вреда организму, остальные принято называть условно-патогенными микроорганизмами. После попадания в организм какой-либо инфекции или снижения иммунитета они становятся вредными и способны стать толчком для возникновения различных заболеваний. Лабораторная диагностика кишечных инфекций предназначена, чтобы вовремя обнаружить присутствие в организме этих патогенных “жителей”.

Кишечные инфекции могут иметь бактериальное либо вирусное происхождение. Наиболее частыми бактериальными формами можно считать дизентерию, а также сальмонеллез. Эти патологии возникают из-за попадания и размножения патогенных возбудителей в органах желудочно-кишечного тракта. Инфекционные процессы такого типа развиваются после приема пищи немытыми руками, питья загрязненной воды, употребления плохо промытых овощных и некоторых фруктовых культур, прочих необработанных продуктов.

Микробы на руках

Условно-патогенные бактерии также способны стать причиной заболевания. Особенно часто они начинают проявлять себя в условиях, когда организм ослаблен. Это может быть как дисбактериоз, так и некоторые другие нарушения пищеварения. Такие болезни могут быть вызваны наличием в организме кишечной палочки.

Инфекционно-вирусные заболевания тоже встречаются довольно часто. Особенно среди них распространены такие, как энтеровирусная, ротавирусная инфекции. Заражение может наступить контактным, воздушно-капельным способом.

Исследование кала, особенно детям, проводят для того, чтобы установить точный диагноз. Ведь симптомы некоторых кишечных заболеваний настолько похожи, что только лишь при проведении тщательной диагностики можно определить, по какой причине они возникли.

Микробиологическое исследование на кишечные инфекции

Анализы кала, а точнее, посев на питательные среды, необходим как раз для определения патогенных микроорганизмов. Непосредственно перед посевом проводится микроскопическое исследование биоматериала. Однако выявить бактерии таким способом часто бывает невозможно, поскольку в исследуемом образце они могут присутствовать в небольшом количестве.

В то же время на питательных средах патогенные микроорганизмы размножаются достаточно активно. Они формируют колонии с характерной морфологией. Чтобы выявить представителей той или иной группы, используют специальные селективные среды. Для энтеробактерий подходят среда Эндо и Мак-Конки, но некоторых представителей семейства, например, сальмонелл, высевают на гемокультуру. А вот возбудитель дизентерии хорошо растет на поверхности простых питательных сред.

Иногда в исследуемом образце материала можно найти условно-патогенные и полезные микроорганизмы.

После того как колонии сформируются на поверхности питательной среды, опять выполняется микроскопическое исследование, но теперь уже чистых культур. Именно после него можно с высокой точностью определить инфекционных возбудителей.

Если в биоматериале были выявлены патогенные микроорганизмы, то следующим этапом исследования обязательно должно быть проведение теста на их чувствительность к различным антибиотикам.

Чтобы получить результат, выявленные бактериальные колонии пересевают на накопительную питательную среду и начинают воздействовать разными видами антибиотиков. Чаще всего применяют метод дисков. На поверхность питательной среды с нанесенной суспензией бактериальных клеток накладывают диски, пропитанные антимикробными средствами. Степень чувствительности определяется по тому, есть ли рост колоний вокруг каждого диска и какова зона стерильности рядом с ним. Чем ближе бактерии “подходят” к диску, тем меньше он на них действует.

Анализ кала методом ПЦР

Естественно, что при диагностике кишечных инфекций чаще исследуют кал. Это неудивительно, ведь именно он даст наиболее четкую картину болезни. Сдавать анализ кала из прямой кишки обязательно нужно для того, чтобы определить, какой именно микроорганизм мог вызвать имеющееся заболевание. Довольно действенный в клинике диагностический метод – полимеразная цепная реакция (ПЦР). Такой способ считается быстрым.

Читайте также:  Сколько ребенок может не есть при кишечной инфекции

Пцр

Метод ПЦР основывается на том, что фрагменты РНК либо же ДНК патогенных бактерий можно обнаружить даже в незначительном количестве биоматериала. Этот анализ подходит для исследования совершенно любой человеческой биожидкости. В случае с кишечными инфекциями берется кал, поскольку в нем содержится наибольшая концентрация возбудителя.

С помощью ПЦР легко обнаружить не только наличие бактерий в биологическом материале, но и определить их численность в кишечнике. Это дополнительный плюс для диагностики инфекций, вызванных условно-патогенными микроорганизмами. В норме они содержатся у человека в составе нормофлоры, но если их концентрация повышена, можно говорить о развитии патологического процесса.

Кроме того, исследование кала методом ПЦР, в отличие от культурального микробиологического метода, дает возможность выявить не только бактерии, но и вирусы.

Экспресс-тест на ротавирусную кишечную инфекцию

Ротавирусная инфекция или же кишечный грипп – это специфическое заболевание инфекционного характера, возбудителями которого являются ротавирусы. Частый путь передачи такой инфекции – фекально-оральный. Эта инфекция попадает в организм главным образом после употребления необработанного молока или любой пищи грязными руками.

В условиях клиники у детей часто проводится экспресс-тест, который помогает определить наличие в организме ротавирусной инфекции. Для исследования берут детские каловые массы. Тест-полоски, находящиеся в комплекте, опускают в отобранный биоматериал приблизительно на 10 минут. Когда время истечет, лаборанты точно могут оценить результаты теста.

Экспресс-тест реагирует на специфический антиген ротавируса. Если полоска поменяла свой цвет, то результат положительный. То есть, ротавирусная инфекция присутствует в организме. Если же цвет полоски остался неизменным, то диагноз поставлен неправильно и нужно искать другие причины заболевания.

Что показывает анализ кала

При проведении анализа кала на кишечные инфекции выявляются следующие микроорганизмы:

  • бактериального происхождения;
  • вирусной этиологии;
  • специфические инфекционные формы.

Бактериальную природу имеют возбудители дизентерии и сальмонеллеза. Зачастую они попадают в организм из-за несоблюдения гигиены рук и после поедания немытых овощей/фруктов. Вирусного происхождения патогены – это, как показывает клинический опыт, чаще всего ротавирусы, аденовирусы и энтеровирусы.

Анализ

Специфические инфекции бывают вызваны слишком активным размножением условно-патогенных микроорганизмов. Пусковым механизмом для их развития чаще всего может стать дисбактериоз или же другие расстройства пищеварения. Точную причину врач установит, только проведя полное обследование пациента.

Как подготовиться к сбору материала для анализа

Готовиться и собирать биоматериал для проведения исследования нужно в соответствии с некоторыми правилами. Прежде всего, посуда, в которую будет помещен исследуемый материал, должна быть стерильной. Только в этом случае можно получить достоверные результаты.

В аптеках продаются специальные стерильные емкости для сбора кала. Они представляют собой пластмассовую баночку, которая герметично закрывается крышкой. В середине нее находится специальная стерильная лопаточка для забора биоматериала.

Собирать анализы на кишечную инфекцию следует, только если больной накануне не употреблял такие препараты:

  • активированный уголь;
  • фармакологические средства, содержащие железо;
  • слабительные;
  • свечи для ректального введения на жировой основе.

Кал следует собирать в утреннее время. Перед этим нужно хорошо опорожнить мочевой пузырь, помыться чистой водой без гигиенических средств. Дефекация должна произойти не в унитаз, а именно в предварительно подготовленную емкость. Сколько необходимо материала? В маленькую посудину с герметично закрывающейся крышкой откладывают 1-2 ложечки кала на последующие анализы.

В лаборатории биоматериал должен оказаться не позже чем через 2 часа после забора. Хранят его в холодильнике. Однако следует помнить, что замораживать пробу нельзя. Чтобы получить достаточно кала, не следует пользоваться клизмой. Все испражнения должны происходить только естественным путем.

Источник



Инфекционные болезни — это заболевания, вызванные проникновением в организм бактерий, грибков или вирусов. Самая важная часть диагностики инфекций — это определение возбудителя и его концентрации. Для этих целей используются разнообразные лабораторные методы, которые позволяют выяснить, чем именно и как давно атакован организм, а в некоторых случаях — спрогнозировать эффективность лечения тем или иным препаратом.

Особенности диагностики инфекционных заболеваний

В клинической практике данный тип заболеваний встречается очень часто. Именно они, по данным Всемирной организации здравоохранения, становятся причиной 26% всех смертей. В список самых распространенных инфекционных заболеваний входят инфекционная пневмония и другие воспалительные заболевания дыхательных путей, гепатит, ВИЧ, туберкулез, малярия, воспаления органов половой системы и мочевыводящих путей, гистоплазмоз, ротавирусные инфекционные заболевания, ветряная оспа, герпес, вирус папилломы человека и еще несколько десятков болезней. Хотя бы раз в жизни каждый из нас сталкивается с инфекционными заболеваниями и необходимостью быстрой постановки диагноза.

Все инфекционные болезни делятся на пять типов — прионные, вирусные, бактериальные, протозойные и грибковые поражения. Далее будут рассмотрены последние четыре типа как наиболее распространенные. Разные возбудители иногда могут вызывать одно и то же заболевание. В частности, пневмония может быть результатом как вирусной, так и бактериальной инфекции. Лечение зависит не от проявлений, а от возбудителя болезни. Противовирусные препараты бесполезны в борьбе с бактериями и грибками, антибиотики не действуют на вирусы. Поэтому основная задача лабораторной диагностики инфекционных заболеваний — выявление типа возбудителя.



На заметку




Слово «Прион» предложено в 1982 году американским врачом, профессором неврологии и биохимии Университета Калифорнии в Сан-Франциско Стенли Прузинером. Это особый класс возбудителей, состоящих их белка. Вызывают такие болезни, как болезнь Крейтцфельда — Якоба, куру, фатальная семейная бессонница.

Способы лабораторной диагностики инфекционных болезней можно разделить на два типа: неспецифические и специфические методы.

Читайте также:  Кишечная инфекция у котенка лечение

К неспецифическим относятся общий анализ крови и исследование соотношения ее белковых фракций, печеночные пробы, общий анализ мочи и кала. Эти методы не дают информации о виде возбудителя, но позволяют узнать, в какой мере болезнь затронула органы и системы организма, что именно в их работе нарушено и насколько далеко зашел процесс.

Специфические — вирусологический и бактериологический методы, микроскопическое исследование возбудителей, анализы на антигены и антитела — направлены непосредственно на обнаружение возбудителя.

Методы лабораторной диагностики бактериальных инфекций

Современная медицина располагает множеством методов выделения возбудителей бактериальной инфекции:



Бактериоскопический


. Исследуется окрашенный специальным образом мазок.



Бактериологический


. Биоматериал высеивается в питательную среду, и через некоторое время специалист исследует колонию бактерий, выросшую в ней.



Биологический


. Направлен на определение патогенности микроорганизмов.



Серологический


. Выявляет антитела и антигены в сыворотке крови — особые вещества, которые вырабатываются организмом при контакте с возбудителем определенной болезни.

Чаще всего для исследований используют кровь или сыворотку крови, реже — слюну, мочу, кал, клетки эпителия (мазок и соскоб) и другой биоматериал.

Диагностика вирусных инфекций

В лабораторной диагностике вирусных заболеваний используются:



Вирусологическое исследование


. Световая и электронная микроскопия дает возможность выявить наличие вирусных включений и сами вирусы и идентифицировать их.



Серологическое исследование


для обнаружения антител и антигенов. Этот метод дает возможность быстро выявить агрессора, как и в случае с бактериальными инфекциями. Для диагностики используются разнообразные способы исследования материала — реакции гемадсорбции, гемагглютинации или метод непрямой иммунофлюоресценции. Имунноблоттинг, в частности, позволяет выявлять антитела сразу к нескольким инфекциям и считается современным и точным диагностическим методом.



Молекулярно-генетические методы


. Последнее слово в лабораторной диагностике. Позволяют обнаружить вирус даже тогда, когда его концентрация ничтожно мала — то есть на самых ранних стадиях. Самым известным из этих методов является ПЦР, при которой фрагмент вируса многократно копируется до тех пор, пока специалист не получит достаточно материала для определения типа вируса и его изначальной концентрации.

Для выявления вирусов обычно требуется сделать анализ крови.



Справка




Вирусные включения представляют собой выявляемые с помощью микроскопа образования в клетках, которые возникли при внедрении в организм вируса.

Методы диагностики протозойных инфекций

Так называют инфекции, вызванные простейшими паразитами, например, амебами. Малярия, амёбиаз, токсоплазмоз, лямблиоз, трихомониаз, сонная болезнь — вот неполный список самых распространенных протозойных инфекций. Лабораторная диагностика таких заболеваний включает в себя следующие методы:



Микроскопический


. Простейшие паразиты выявляются путем исследования под микроскопом окрашенных образцов биоматериала. Самый простой и надежный метод для многих возбудителей.



Культуральный


. Посев биоматериала в питательную следу для дальнейшего исследования размножившихся простейших. У этого метода есть существенный недостаток: результатов нужно ждать долго, сам процесс может занять не менее 5-6-ти дней.



Серологический


. Используют редко ввиду малой информативности.



Аллергический


. Также не является распространенным. Кожные аллергопробы делают для того, чтобы подтвердить лейшманиоз и токсоплазмоз. Это вспомогательный диагностический метод.

В качестве биоматериала для исследований в основном используется кровь, иногда — – кал или моча.

Диагностика грибковых инфекций

Грибковые инфекции распространены не так широко, как вирусные или бактериальные потому, что они поражают в основном людей с ослабленным иммунитетом. Обычно при словах «грибковая инфекция» люди думают о заболеваниях кожи и ногтей, но сфера деятельности микозов шире: они могут поражать практически любые ткани. Самые распространенные грибковые поражения – это кандидоз, или молочница, микозы стоп, аспергиллез. При диагностике грибковых инфекций чаще всего используются следующие лабораторные методы:



Микроскопическое исследование


. Препарат окрашивается и рассматривается под мощным микроскопом. Посредством иммунофлюоресцентной микроскопии исследуется проба, помеченная флюоресцеинами — специальным красителем. Наиболее быстрый способ выявления грибка по сравнению с другими методами.



Культуральный


. Происходит посев пробы на питательную среду и дальнейшее исследование полученной в результате колонии грибков.



Серологический


. Используется для выявления грибковых поражений, однако для микозов он считается не особенно точным.



Гибридизация нуклеиновых кислот


. Самый современный способ выявления грибковых инфекций, его применяют для идентификации основных возбудителей системных микозов. Из культуры извлекается РНК и вносится особым способом помеченная молекула ДНК. Если в пробе наличествует один из основных патогенных грибков, ДНК объединится с его РНК, создав легко различимую структуру. Несомненным преимуществом метода является возможность определить инфекцию на самых ранних стадиях.

Биоматериалом для исследований являются клетки кожи, волос и ногтей, клетки слизистых оболочек (мазок или соскоб), мокрота, моча, секрет простаты, сперма, грудное молоко.


Современные методики диагностики инфекций позволяет выявить их на начальном этапе, Чем раньше болезнь будет обнаружена, тем проще ее вылечить. Поэтому сдавать анализы на инфекции желательно регулярно, даже если вы ни на что не жалуетесь и не замечаете никаких перемен в самочувствии.

Источник