Мук по кишечным инфекциям

МУК 4.2.2746-10

Дата введения: с момента утверждения

1. Методические указания
разработаны Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав
потребителей и благополучия человека (Е.Б.Ежлова, Ю.В.Демина), ФГУН
«Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии»
Роспотребнадзора (А.Т.Подколзин, К.В.Кулешов, Г.А.Шипулин,
В.В.Малеев, В.И.Покровский).

2. Рекомендованы к
утверждению Комиссией по государственному
санитарно-эпидемиологическому нормированию при Федеральной службе
по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия
человека.

3. Утверждены
Руководителем Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав
потребителей и благополучия человека, Главным государственным
санитарным врачом Российской Федерации Г.Г.Онищенко 30 сентября
2010 г.

4. Введены в действие с
30 сентября 2010 года.

5. Введены впервые.

1.
Область применения

1.1. В настоящих
методических указаниях определены порядок применения
молекулярно-генетических методов исследования, а также сбора,
упаковки, хранения и транспортирования биологического материала и
образцов объектов окружающей среды (ООС) при обследовании очагов
острых кишечных инфекций с групповой заболеваемостью различной
этиологии, вызванных ПБА III-IV группы, не относящимися к
условно-патогенной флоре (УПФ).

1.2. Методические
указания предназначены для специалистов органов и учреждений
Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и
благополучия человека, а также могут быть использованы
лечебно-профилактическими и другими учреждениями, независимо от
ведомственной принадлежности и организационно-правовой формы.

2.
Список сокращений

ВОЗ — всемирная
организация здравоохранения

ЖКТ — желудочно-кишечный
тракт

ОКИ — острые кишечные
инфекции

ООС — объекты окружающей
среды

ОТ-ПЦР — полимеразная
цепная реакция с обратной транскрипцией

ПБА — патологические
биологические агенты

ПЦР — полимеразная цепная
реакция

УПФ — условно-патогенная
флора

AFLP — оценка
полиморфизма длины фрагментов амплификации

EIEC — энтероинвазивные
E. coli

LCR — лигазная цепная
реакция

MLST — мультилокусное
секвенирование-типирование

NASBA — метод
изотермической амплификации РНК (Nucleic Acids Seaquencence
Amplification
)

PFGE — электрофорез в
пульсирующем поле

RAPD — амплификации со
случайными праймерами

VNTR — амплификация
тандемных повторов с переменной копийностью

3.
Общие положения


К
молекулярно-генетическим методам исследования относятся методы
выявления и характеристики инфекционных агентов на основе
исследования их нуклеиновых кислот с применением или без применения
амплификационных технологий путем определения наличия, размера и
нуклеотидного состава различных элементов генома возбудителя, либо
сочетания этих подходов.

Наибольшее
распространение получили амплификационные методы на основе
полимеразной цепной реакции (ПЦР). Для выявления ее продуктов
применяются методы гель-электрофореза, гибридизации с
флуоресцентно-меченными зондами, гибридизационно-ферментное
выявление продуктов ПЦР и способы детальной характеристики продукта
с применением нуклеотидных биочипов и метода прямого секвенирования
нуклеотидных последовательностей продуктов реакции.

Достаточно широкое
распространение имеют также методы анализа генома возбудителя без
применения амплификационных технологий. Наиболее распространенным
из них является метод электрофореза в пульсирующем поле.

Применение
молекулярно-генетических методов исследования должно
рассматриваться не как альтернатива, а как обязательное дополнение
к регламентированным схемам диагностики острых кишечных инфекций,
позволяющее оперативно выявлять комплекс возбудителей ОКИ и
проводить оценку идентичности бактериальных и вирусных
изолятов.

4.
Организация исследований

4.1.
Молекулярно-генетические методы исследования в очагах ОКИ с
групповой заболеваемостью применяются для решения следующих
задач:


наиболее раннего установления этиологии заболеваний с целью
своевременного начала адекватной терапии и проведения
соответствующих санитарно-противоэпидемических (профилактических)
мероприятий;


выявления ДНК/РНК возбудителей в предполагаемых факторах передачи и
источниках инфицирования;


оценки идентичности изолятов возбудителей, выделенных из различных
материалов с целью определения источников инфицирования и факторов
передачи инфекции.

4.2. Применение
молекулярно-генетических методов исследования является обязательным
в случае исследования материала из очагов ОКИ с групповой
заболеваемостью:


при регистрации в очаге групповой заболеваемости ОКИ летальных
исходов от данных заболеваний, в том числе установленной
этиологии;


при отсутствии выделения от пациентов (>30% обследованных)
безусловных патогенов в эпидемически значимых количествах в сроки,
регламентированные действующими нормативно-методическими
документами;


при выделении от больных только условно-патогенной флоры в
единичных случаях, без достоверно выявленного фактора передачи
возбудителя;


при проведении детекции вирусных агентов в материалах из окружающей
среды, продуктов питания или лиц — предполагаемых источников
инфицирования (если такая область применения регламентируется
производителем диагностических препаратов);


при проведении оценки идентичности изолятов микроорганизмов,
выявленных из различных источников и нерезультативном применении
при этом комплекса классических микробиологических и серологических
методик.

4.3. При работе в
эпидемических очагах ОКИ формирование панели образцов для
исследования с определением количества обследуемых больных, лиц,
подвергшихся риску заражения, декретированного контингента,
образцов ООС и выделенных изолятов возбудителей определяется
специалистами, уполномоченными осуществлять государственный
санитарно-эпидемиологический надзор в соответствии с действующими
нормативно-методическими документами.

4.4. Для обеспечения
контроля качества проводимых исследований целесообразно
дополнительно направлять на исследование клинический материал от
лиц без клинических проявлений заболевания, не имеющих
эпидемиологической связи с обследуемым очагом в количестве ~20% от
количества лиц, имеющих эпидемиологическую связь с очагом в виде
единой зашифрованной отправителем панели. Клинический материал от
лиц — предполагаемых источников инфицирования не подлежит
зашифровке в целях правильной организации лабораторных
исследований.

Читайте также:  Кишечные инфекции и их профилактика брюшной тиф

4.5. Первичное
молекулярно-генетическое исследование (ПЦР-диагностика)
клинического материала от больных проводится в лабораториях
лечебно-профилактических учреждений (ЛПУ), ФГУЗ «Центр гигиены и
эпидемиологии» в субъекте Российской Федерации, имеющих в своем
составе ПЦР-лаборатории.

4.6. Первичное
молекулярно-генетическое исследование предполагаемых источников
инфицирования, лиц, подвергшихся заражению, и ООС осуществляют на
базе ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии» в субъекте Российской
Федерации, имеющих в своем составе ПЦР-лаборатории.

Источник


МУК 4.2.992-00

Дата введения 2001-02-04

1. РАЗРАБОТАНЫ
Федеральным центром госсанэпиднадзора Минздрава России
(Л.Г.Подунова, Н.С.Кривопалова, Р.С.Сорокина), Центром
госсанэпиднадзора в Тульской области (Л.И.Шишкина, Т.А.Попова,
А.Я.Сыпченко, Н.М.Корнеева), Государственным научным центром
прикладной микробиологии (М.В.Храмов).

2. УТВЕРЖДЕНЫ Главным
государственным санитарным врачом Российской Федерации — Первым
заместителем министра здравоохранения Российской Федерации
Г.Г.Онищенко 4 ноября 2000 г.

3. ВВЕДЕНЫ ВПЕРВЫЕ.

1.
Область применения

1. Настоящие методические
указания предназначены для бактериологических лабораторий центров
государственного санитарно-эпидемиологического надзора, других
учреждений системы здравоохранения Российской Федерации,
осуществляющих бактериологическую диагностику острых кишечных
инфекций с гемоколитом и развитием гемолитико-уремического
синдрома, а также обследование контактных в очагах заболевания и
контроль за качеством продовольственного сырья и пищевых
продуктов.

2. Методические указания
определяют методы обнаружения, выделения и идентификации
энтерогеморрагической кишечной палочки Е. coli О157:Н7 и
разработаны в связи с отсутствием в настоящее время нормативных
документов по данному разделу бактериологических исследований.

3. Методические указания
являются обязательными при контроле продуктов детского питания,
молочных и мясных продуктов в ходе проведения противоэпидемических
мероприятий при возникновении вспышек, а также осуществления
санитарно-эпидемиологического надзора.

4. Настоящие методические
указания созданы с целью унификации и дальнейшего совершенствования
бактериологических методов выделения и идентификации
энтерогеморрагической кишечной палочки Е. coli О157:Н7 в связи с
регистрацией данной патологии на территории Российской Федерации, а
также роста заболеваемости вспышечного характера и спорадической за
рубежом.

2.
Сущность метода


Методические указания
содержат описание микробиологического исследования с целью
выделения и идентификации энтерогеморрагической кишечной палочки Е.
coli О157:Н7 из биоматериала от больных неосложненными диареями,
острыми кишечными инфекциями с гемоколитом и развитием
гемолитико-уремического синдрома, от контактных в очаге, а также
пищевых продуктов, сырья.

Предлагаемый
дифференциально-диагностический метод основан на использовании
некоторых особенностей биохимических свойств данного
микроорганизма: отсутствии фермента -D-глюкуронидазы и способности
ферментировать сорбитол, а также на наличии у Е. coli О157:Н7
такого «маркера», как продукция веротоксинов (VT1, VT2).

Для осуществления
возможности практического использования данной методики в течение
короткого периода времени разработана отечественная питательная
среда «Сорбитол Е. coli О157:Н7 агар» (ФС 42-0027-00) для выделения
Е. coli О157:Н7 из клинического материала, объектов окружающей
среды (разработчик — Государственный научный центр прикладной
микробиологии, отделение «Питательные среды», г.Оболенск
Серпуховского района Московской области), а также созданы
диагностические сыворотки для реакции агглютинации и методика
определения веротоксинов в клиническом материале.

Огромный интерес,
проявляемый к острым кишечным инфекциям с гемолитико-уремическим
синдромом (ГУС) со стороны научных центров и практического
здравоохранения за рубежом и в нашей стране, закономерен.

Количество регистрируемых
заболеваний острыми кишечными инфекциями с гемолитико-уремическим
синдромом, как вспышечного характера, так и спорадических, ежегодно
возрастает (США, Канада, Финляндия, Япония, Европа).

Этиологическим фактором
этих заболеваний являются энтерогеморрагические кишечные палочки,
продуцирующие веротоксины (шигаподобные токсины). Они представлены
довольно большим разнообразием серологических вариантов, из которых
Е. coil О157:Н7 имеет наибольшее эпидемиологическое значение в
качестве причин неосложненных диарей и кровавого поноса с
последующим развитием ГУС.

К
настоящему времени биология эшерихии Е. соli О157:Н7,
эпидемиология, патогенез и диагностика связанных с ней заболеваний
достаточно изучены.

Первые сведения о
выделении Е. coli О157:Н7 и регистрация данной патологии в нашей
стране имели место в Тульской области, где диагностика острых
кишечных инфекций с гемолитико-уремическим синдромом начата с конца
1996 года.

Результаты выделения Е.
coli О157:Н7 из клинического материала от детей, больных ОКИ,
сырья, пищевых продуктов (сырого мяса, молока) получены в 1997-99
гг.: установление этиологического фактора (Е. coli О157:Н7) случаев
острых кишечных инфекций, осложненных гемолитико-уремическим
синдромом, составило в Тульской области 43%, высеваемость Е. coli
О157:Н7 из пищевых продуктов и сырья 1,96%; высеваемость культур от
животноводов и доярок ферм — 9%.

Наибольшему риску
подвержены дети до 5 лет и пожилые люди.

Естественным резервуаром
бактерий Е. coli О157:Н7, патогенных для человека, служит крупный
рогатый скот, овцы. Наиболее частый путь распространения этой
инфекции — пищевой. Основным фактором передачи является сырая
говядина, особенно мясной фарш, мясные полуфабрикаты, прошедшие
недостаточную термическую обработку, сырое молоко. Отмечены случаи
передачи возбудителя через воду.

Читайте также:  Бактериальная кишечная инфекция неуточненной этиологии

3.
Нормативные ссылки

3.1. «Основы
законодательства Российской Федерации об охране здоровья граждан»
от 22.07.93 г.N 5487-1.

3.2. Федеральный
закон «О санитарно-эпидемиологическом благополучии населения» от 30
марта 1999 г. N 52-ФЗ.

3.3. СанПиН
2.3.2.560-96 «Гигиенические требования к качеству и безопасности
продовольственного сырья и пищевых продуктов»*.
___________________
*
Действуют СанПиН
2.3.2.1078-01. — Примечание «КОДЕКС».

3.4. ГОСТ
26668-85 «Продукты пищевые и вкусовые. Методы отбора проб для
микробиологических исследований».

3.5. ГОСТ
26669-85 «Продукты пищевые и вкусовые. Подготовка проб для
микробиологических анализов».

3.6. ГОСТ
26670-91 «Продукты пищевые. Методы культивирования
микроорганизмов».

3.7. ГОСТ
10444.1-84 «Консервы. Приготовление растворов, красок, индикаторов,
питательных сред, применяемых в микробиологическом
анализе».

3.8. ГОСТ Р 50474-93 «Продукты пищевые. Методы
выявления и определения количества бактерий группы кишечных палочек
(колиформных бактерий)».

3.9. ГОСТ Р 50480-93 «Продукты пищевые. Методы
выявления бактерий рода Salmonella».

3.10. ГОСТ
9225-84 «Молоко и молочные продукты. Методы микробиологического
анализа».

3.11. ГОСТ
9792-73 «Колбасные изделия и продукты из свинины, баранины,
говядины и мяса других видов убойных животных и птиц. Правила
приемки и методы отбора проб».

3.12. ГОСТ
9958-81 «Изделия колбасные и продукты из мяса. Методы
бактериологического анализа».

3.13. ГОСТ
21237-75 «Мясо. Методы микробиологического анализа».

3.14. ГОСТ
4288-76 «Изделия кулинарные и полуфабрикаты из рубленого мяса.
Правила приемки и методы испытания».

3.15. ГОСТ Р 50396.0-92 «Мясо птицы, субпродукты и
полуфабрикаты птичьи. Методы отбора проб и подготовка к
микробиологическим исследованиям».

3.16. ГОСТ
7702.2.2-93 «Мясо птицы, субпродукты и полуфабрикаты птичьи. Методы
выявления и определения количества бактерий группы кишечных
палочек».

3.17. ГОСТ
7702.2.3-93 «Мясо птицы, субпродукты и полуфабрикаты птичьи. Методы
выявления сальмонелл».

3.18. МУ
04-723/3 от 17.12.84 г. Методические указания по
микробиологической диагностике заболеваний, вызываемых
энтеробактериями.

3.19. Инструкция к
применению «Набора реагентов для выявления веротоксина у эшерихий»
(фирма «Seiken», Япония).

4.
Методы забора, доставки проб клинического материала от больных и
контактных


Важным условием выделения
эшерихий Е. coli О157:Н7 из клинического материала является отбор и
доставка его в лабораторию в возможно ранние сроки: оптимальными
сроками являются 1-3 день от момента заболевания.

У
больных интенсивность выделения возбудителя снижается, достигая 50%
и более низкого уровня через 5-8 дней от начала заболевания.
Гемолитико-уремический синдром обычно развивается спустя, как
минимум, одну неделю после первых признаков диареи, и вероятность
обнаружения возбудителя к этому времени существенно
уменьшается.

Материалом для
бактериологического исследования служат в первую очередь
испражнения, моча.

Испражнения собирают в
консервант, в качестве которого можно использовать
фосфатно-буферную или глицериновую смеси. В случае доставки
материала в течение 2 часов с момента забора нативные испражнения
отбирают в стерильные флаконы.

При обследовании
контактных лиц с целью выявления бактерионосителей возможно взятие
материала ректальными тампонами, проволочными петлями.

Мочу после туалета
наружных половых органов собирают в стерильную посуду. Перед
посевом мочу центрифугируют и засевают осадок. В случае небольшого
количества осадка засевают нативную мочу в среду обогащения двойной
концентрации в равных объемах (приложение 1).

5.
Методы подготовки пищевых продуктов для бактериологического
исследования и схемы посева на питательные среды


Методы отбора проб,
хранение и подготовка их к анализу регламентированы в действующих
нормативных документах на конкретный вид продукта (раздел 3
«Нормативные ссылки»).

Проведение испытаний
различных пищевых продуктов устанавливает единый метод выявления в
определенной навеске пищевого продукта колиформных бактерий в
соответствии с ГОСТ Р 50474-93
«Продукты пищевые. Методы выявления и определения количества
бактерий группы кишечных палочек (колиформных бактерий)». По
классификации кишечных палочек Е. coli 0157:Н7 относится к
энтерогеморрагическим, энтеропатогенным кишечным палочкам, поэтому
выявление ее как патогена необходимо проводить в 25 г продукта.
Возможно выявление Е. coli О157:Н7 в других объемах,
регламентированных нормативной документацией на конкретный вид
продукта, а также СанПиН
2.3.2.560-96 «Гигиенические требования к качеству и
безопасности продовольственного сырья и пищевых продуктов»
(приложения 2, 3).

6.
Проведение анализа


Принципы
бактериологического исследования с целью выделения Е. coli О157:Н7
не отличаются от общепринятых для возбудителей острых кишечных
инфекций и включают методы классического бактериологического
исследования, основанные на выделении чистой культуры
микроорганизма и последующей его идентификации по
культурально-морфологическим, биохимическим, антигенным свойствам.
Основным критерием отнесения штамма к группе энтерогеморрагических
эшерихий являются данные, подтверждающие продукцию веротоксинов.
Штаммы, не продуцирующие токсинов, не могут считаться возбудителями
эшерихиозов у людей.

Читайте также:  Дюфалак при кишечной инфекции

6.1. Посев клинического
материала с целью выделения Е. coli О157:Н7 проводится на
питательную среду Сорбитол Е. coli О157:Н7 агар (прямой посев) и в
соотношении 1:5 в среды накопления, которыми могут служить бульон
лактозный с бриллиантовым зеленым и желчью (ГОСТ Р 50474-93), GN Enrichment Broth
асс. to HAJNA (Cat. N 10756, фирма «MERCK», Германия). При
отсутствии нативного материала испражнения, забранные в консервант,
засевают в среду обогащения двойной концентрации (приложение
1).

6.2. Посев пищевых
продуктов для выявления БГКП (колиформных бактерий) в определенной
навеске продукта проводится в соответствии с ГОСТ Р 50474-93. Дополнительной
питательной средой для выявления Е. coli О157:Н7 является Сорбитол
E. coli О157:Н7 агар (приложение 2), потому что плотная питательная
среда, используемая для выделения колиформных бактерий (Эндо), не
может быть использована для целенаправленного поиска E. coli
О151:Н7, т.к. данный микроорганизм разлагает лактозу подобно другим
эшерихиям.

6.3. Подготовку пищевых
продуктов для выявления E. coli О157:Н7 с применением сред
обогащения осуществляют в соответствии с ГОСТ Р 50480-93 «Продукты пищевые.
Методы выявления бактерий рода Salmonella», но в качестве сред
обогащения могут быть использованы среда Кесслера, трипказо-соевый
бульон, бульон лактозный с бриллиантовым зеленым и желчью,
Грам-негативный бульон (GN-бульон). После термостатирования посевов
при 37 °С в течение 18-24 ч проводят высев на плотную среду
Сорбитол Е. coli О157:Н7 агар, обладающую дифференциальными и
селективными свойствами (приложение 3).

Отличительным
биохимическим свойством Е. coli О157:Н7 является отсутствие
способности ферментировать сорбитол. Для выделения штаммов Е. coli
О157:Н7 необходимо использовать Сорбитол Е. coli О157:Н7 агар или
среды зарубежного производства: Fluorocult Е. coli О157:Н7 Agar (Cat. N 1.04036);
Sorbitol MacConkey Agar (SMAC-agar) Cat. N 1.09207;
Fluorocult HC Agar acс. to SZABO Cat. N 1.09206 (фирма
«MERCK», Германия).

Характеристика роста Е.
coli О157:Н7 на плотных питательных средах представлена в
табл.1.

Таблица
1

Характеристика роста Е. coli О157:Н7 на плотных
питательных средах

Питательная
среда

Характер
колоний

Среда ЭНДО

Колонии
средней величины, выпуклые, круглые, влажные, темно-красные,
Lac

Сорбитол Е. coli О157:Н7
агар

Колония
средней величины, выпуклые, круглые, влажные, бесцветные,
прозрачные. Могут быть бледно-розовые со светлым ореолом,
мутноватые

Fluorocult Е. coli О157:Н7
Agar

Прозрачные или
полупрозрачные колонии, бесцветные, размером 1,5-2 мм

Простой питательный
агар

Колонии
средней величины, выпуклые, круглые, влажные, блестящие, прозрачные
в проходящем свете

Агар Плоскирева,
Висмут-сульфит агар, ЖСА, среда Сабуро

Роста нет.
Иногда на среде Плоскирева — мелкие выпуклые колонии красноватого
цвета, Lac

Кровяной агар

Колонии
средней величины, выпуклые, круглые, влажные, бледноватые, иногда
сероватые. Гемолиз отсутствует

Если на чашке с Сорбитол
Е. coli О157:Н7 агаром выросли 1-2 сорбитол-отрицательных колонии,
то серологические исследования проводят после посева на одну из
сред для первичной дифференциации: агар Клиглера, Олькеницкого,
Ресселя. В случае роста на чашке Петри однотипной культуры с 3-5
колониями проводят серологическую идентификацию на стекле с «О»- и
«Н»-сыворотками к антигенам Е. coli О157:Н7, либо с латексным
антительным диагностикумом.

Не менее 5
сорбитол-отрицательных колоний пересевают на среду для первичной
идентификации. Посевы инкубируют в термостате при 37 °С 18-24 часа.
При получении на следующий день результатов, подтверждающих
принадлежность культуры к роду эшерихий (ферментация глюкозы и
лактозы с образованием кислоты и газа, отсутствие HS), проводят дальнейшую биохимическую и
серологическую идентификацию (приложения 2, 3).

7.
Биохимические свойства и серологическая идентификация Е. соli
O157:Н7


Серологическая
идентификация предусматривает выявление «О»- и «Н»-антигенов у
эшерихий Е. coli О157:Н7.

Определение «О»- и
«Н»-антигенов проводится в обычной реакции агглютинации на стекле с
эшерихиозными сыворотками к Е. соli O157:Н7, выпускаемыми АООТ
«Биомед» имени И.И.Мечникова (Московская область, Красногорский
район, с.Петрово-Дальнее) или латексным антительным диагностикумом
производства ГНЦ ПМ (Московская область, Серпуховской район,
г.Оболенск). Реакция агглютинации осуществляется в соответствии с
наставлениями по применению данных сывороток.

Необходимо отметить, что
Е. coli О157:Н7 имеет антигенные связи с другими эшерихиями
(табл.2).

Таблица
2

Антигенные связи Е. соli О157:Н7 и других эшерихий

Е. coli

Наименование
сывороток

О157

Н7

О2-О17

О19-О49

О51-О54

О56-О115

О117-О164

О50

О116

+

О1; О18; О55

+

О157:Н7

+

+

Все штаммы, дающие
положительную реакцию агглютинации, подлежат обязательной
биохимической идентификации для подтверждения видовой
принадлежности. Биохимические свойства Е. coli О157:Н7 отражены в
табл.3.

Таблица
3

Основные биохимические свойства Е. coli О157:Н7

N

Тест или
субстрат

Наименование
штаммов

Е. соli
O157:Н7

Е. coli

1

Сорбитол

+

2

-D-глюкуронидаза

+

3

Цитрат Симмонса

4

Мочевина

5

Малонат натрия

6

Сероводород

7

Фенилаланиндезаминаза

Источник