Рнк вируса гепатита с генотипирование

Вирус гепатита С, HCV ПЦР real-time генотипирование (типы 1а, 1b, 2, 3, 4) — определение вируса гепатита С в сыворотке крови и определение генотипов ВГС 1а, 1b, 2, 3, 4 методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с детекцией в режиме «реального времени».

Метод ПЦР — позволяет идентифицировать в биологическом материале искомый участок генетического материала и обнаружить единичные молекулы ДНК вируса, не выявляемые другими методами. Принцип метода основан на многократном увеличении числа копий, специфичного для данного возбудителя участка ДНК.

С помощью ПЦР-анализа можно диагностировать инфекцию в остром периоде и выявлять случаи носительства.

Вирус гепатита С
Исследование позволяет выявить присутствие РНК вируса гепатита С (субтипы 1a, 1b, 2a, 2b, 2c, 2i, 3) и идентифицировать генотипы 1a, 1b, 2, 3 (субтипы a/b).

Вирус гепатита С (ВГС) поражает клетки печени, а также некоторые клетки крови (нейтрофилы, моноциты, В-лимфоциты).

Вирус гепатита С подразделяют на 6 генотипов, каждый из которых, в свою очередь подразделяется на субтипы. Генотипы 1, 2 и 3 являются самыми распространенными в мире. В Российской Федерации чаще распространен генотип 1b, чем 1a, далее с убывающей частотой — 3, 1a, 2.

Генотипирование вируса гепатита С
Генотип вируса гепатита С является наиболее важным фактором, от которого зависит эффективность и тактика противовирусного лечения хронического гепатита С. Знание генотипа вируса используется для планирования продолжительности курса лечения, что особенно важно, учитывая широкий спектр побочных действий применяемых препаратов интерферона и плохую переносимость терапии многими пациентами. Генотипирование вируса гепатита C должно выполняться всем пациентам до начала противовирусной терапии, в целях планирования ее продолжительности, прогнозирования эффективности, в отдельных случаях — для расчета дозы противовирусных препаратов.

Основной путь передачи вируса гепатита С — кровь (препараты для переливания элементов крови и плазмы, донорские органы, нестерильные шприцы, иглы, инструменты), реже — заражение половым путём.

Острый вирусный гепатит
Острый вирусный гепатит, как правило, протекает бессимптомно и в большинстве случаев остаётся невыявленным. У 60–85 % инфицированных развивается хроническая инфекция, которая увеличивает риск развития цирроза, печёночной недостаточности и гепатоцеллюлярной карциномы.

Лечение при различных генотипах вируса гепатита С
Генотип 1 хуже поддаётся лечению, чем генотипы 2 и 3. Кроме того, биопсию печени важнее провести именно при генотипе 1. Повышенные дозы препаратов интерферона рекомендованы для пациентов с 1-м и 4-м генотипами. Курс терапии у таких пациентов должен быть продлён до 48 недель даже при отсутствии вируса в крови более 24 недель. В случае успешности лечения, которая подтверждается снижением вирусной нагрузки крови (< 50 МЕ/мл за 4 недели), вероятен более короткий срок терапии. Если количество вирусных копий не снизилось на 2 порядка за 12 недель, значит, лечение неэффективно и его необходимо пересмотреть.

Генотипы 2 и 3 хорошо поддаются терапии в 80% случаев.

Показания

При обнаружении РНК вируса гепатита С и планировании противовирусной терапии.

Подготовка
Кровь необходимо сдавать утром с 08.00–12.00, спустя 2–4 часа после последнего приёма пищи. Накануне сдачи исследования нужно исключить физические и психоэмоциональные нагрузки.

Интерпретация результатов
Форма представления результата:

обнаружена РНК вируса гепатита С, с указанием субтипа — выдаётся в случае обнаружения у пациента присутствия РНК ВГС и возможности её типирования;
обнаружена РНК вируса гепатита С — выдается в случае обнаружения у пациента присутствия РНК ВГС, которую нельзя отнести к генотипам 1, 2, 3 или 4;
не обнаружено — РНК вируса гепатита С не выявлена или концентрация возбудителя ниже предела чувствительности метода.

Источник

[09-010]
HCV, генотипирование (типы 1a, 1b, 2, 3a, 4), РНК [реал-тайм ПЦР]

1355 руб.

Молекулярно-генетическое исследование для определения генотипа вируса гепатита С.

Применяемый набор реагентов может быть использован для диагностики вируса гепатита С и наиболее распространенных на территории России генотипов HCV (1a, 1b, 2, 3a и 4) in vitro.

Синонимы русские

Вирус гепатита С (ВГС).

Синонимы английские

Hepatitis C Virus (HCV) Genotyping, HCV Subtype.

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Венозную кровь.

Как правильно подготовиться к исследованию?

Не курить в течение 30 минут до исследования.

Общая информация об исследовании

Вирус гепатита С (ВГС) способен поражать клетки печени, а также некоторые клетки крови (нейтрофилы, моноциты, В-лимфоциты). В основном инфекция передается через кровь (препараты для переливания элементов крови и плазмы, донорские органы, нестерильные шприцы, иглы, инструменты), реже вероятно заражение половым путем.

Острый вирусный гепатит, как правило, протекает бессимптомно и в большинстве случаев остается невыявленным. У 60-85 % инфицированных развивается хроническая инфекция, которая увеличивает риск развития цирроза, печеночной недостаточности и гепатоцеллюлярной карциномы. За свое скрытое, но разрушительное действие инфекция получила неофициальное название «ласковый убийца».

ВГС обладает наибольшей вариабельностью среди всех возбудителей вирусных гепатитов и благодаря высокой мутационной активности способен избегать воздействия защитных механизмов иммунной системы. Геномы вируса значительно отличаются в разных странах мира и имеют различную чувствительность к препаратам интерферонов.

Существует 6 основных генотипов вируса гепатита С и около 500 субтипов. Наиболее распространен в мире генотип 1 (40-80 %). 1а тип часто выявляется в США, 1b характерен для Западной Европы и Южной Азии. Генотип 2 встречается с частотой 10-40 %. Генотип 3 распространен в Шотландии, Австралии, Индии и Пакистане. ВГС 4 типа характерен для Средней Азии и Северной Африки, генотип 5 – для Южной Африки, 6 – для некоторых стран Азии. В России преобладает генотип 1b, далее с убывающей частотой — 3, 1a, 2, в США – 1a/1b, 2b, и 3a.

Противовирусная терапия, направленная на подавление прогрессирования заболевания, в редких случаях может ускорить развитие осложнений со стороны печени. Это происходит при неправильной оценке клинических и лабораторных показателей. Генотипирование РНК вируса гепатита С позволяет спрогнозировать эффект от планируемой терапии.

Генотип 1 хуже поддается лечению, чем генотипы 2 и 3. Кроме того, биопсию печени важнее провести именно при генотипе 1. Повышенные дозы препаратов интерферона рекомендованы для пациентов с 1-м и 4-м генотипами. Курс терапии у таких пациентов должен быть продлен до 48 недель даже при отсутствии вируса в крови более 24 недель. В случае успешности лечения, которая подтверждается снижением вирусной нагрузки крови (

Генотипы 2 и 3 хорошо поддаются терапии в 80 % случаев, обычно это занимает 24 недели.

Лечение разрабатывается с учетом пола и возраста пациента, присутствующих у него симптомов, ранее проводимой терапии, структуры и функции печени, а также лабораторных показателей.

Для чего используется исследование?

Чтобы определить необходимость лечения и спрогнозировать течение заболевания.
Для планирования длительности противовирусной терапии и дозировки лекарств.
Для прогнозирования эффективности лечения.
Для принятия решения о биопсии печени.

Когда назначается исследование?

При обнаружении РНК вируса гепатита С и планировании противовирусной терапии.

Что означают результаты?

Референсные значения: РНК HCV не обнаружена.

При обнаружении указывается генотип:

Результат	Значение
Генотипы 1а, 1b	Очень высокий риск хронизации инфекции и развития тяжелых осложнений. Необходимо лечение более высокими дозами интерферона в течение 48 недель.
Генотипы 2, 3a	В большинстве случаев в течение 24 недель достигается планируемый терапевтический эффект.
Генотип 4	Труднее поддается лечению, требует доз препаратов, отличных от применяемых при терапии с генотипами 2 или 3.

Что может влиять на результат?

Генотип вируса гепатита С иногда не выявляется при концентрации вируса в крови менее 1,25*10^3 МЕ/мл.

Важные замечания

Решение о длительности терапии, необходимой дозе препаратов и прекращении лечения может принять только лечащий врач на основании биохимических анализов функции печени, биопсии (при необходимости) и вирусной нагрузки.
Существует вероятность повторного заражения вирусным гепатитом С другого генотипа из-за отсутствия перекрестного иммунного ответа и стойкого иммунитета.

Также рекомендуется

Anti-HCV, антитела, ИФА
Аnti-HCV, антитела
Антитела к структурным и неструктурным белкам вируса гепатита С
HCV, РНК [реал-тайм ПЦР]
HCV, РНК количественно [реал-тайм ПЦР]
Гамма-глютамилтранспептидаза (гамма-ГТ)
Аланинаминотрансфераза (АЛТ)
Аспартатаминотрансфераза (АСТ)
Фосфатаза щелочная общая
Альбумин в сыворотке
Билирубин общий
Холестерол общий
Тромбиновое время
Фибриноген
Общий анализ крови (без лейкоцитарной формулы и СОЭ)
Лейкоцитарная формула
Скорость оседания эритроцитов (СОЭ)

Кто назначает исследование?

Инфекционист, гепатолог.

Литература

Возианова Ж. И. Инфекционные и паразитарные болезни: В 3х т. — К.: Здоровье, 2000 – Т.1.: 600-690.
Кишкун А. А. Иммунологические и серологические исследования в клинической практике. — М.:ООО МИА, 2006 – 471-476 с.
Germer J., Mandrekar J., and others. Hepatitis C Virus Genotypes in Clinical Specimens Tested at a National Reference Testing Laboratory in the United States. J Clin Microbiol. 2011 August; 49(8): 3040–3043. PMCID: PMC3147781.
Kuzin S., Samokhvalov E., Zabotina E, and others. Hepatitis virus genotype structure in patients with chronic hepatitis C. Zh Mikrobiol Epidemiol Immunobiol. 2011 May-Jun;(3):33-8. PMID:21809642.
Mahaney K, Tedeschi V, Maertens G, et al, “Genotypic Analysis of Hepatitis C Virus in American Patients,”Hepatology, 1994, 20(6):1405-11. PubMed 7982639.
Paintsil E, Verevochkin SV, and others Hepatitis C virus infection among drug injectors in St Petersburg, Russia: social and molecular epidemiology of an endemic infection.Addiction. 2009 Nov;104(11):1881-90. Epub 2009 Aug 27. PMID:19712125.

Источник

Содержание:

Зачем нужно знать генотип
Как генотип определяется
Генотипы
- Первый
- Второй
- Третий
- Четвёртый, пятый, шестой
Вывод

Почему важно определить генотип гепатита С?

Для проведения адекватной терапии, подбора лекарственных средств и составления прогноза исхода заболевания.

ВОЗ выделяет 6 основных генотипов вируса гепатита С. Каждый определенный тип наиболее распространен в конкретном регионе или стране. Генотипы от 1 до 3 распространены по всему миру, на Ближнем Востоке, в Африке у пациентов 4 генотип определяют чаще, шестой присущ азиатским странам, пятый распространен в ЮАР.

Статья опубликована при поддержке исследовательского института индийского фармацевтического производителя Zydus Heptiza. Официальный сайт в России Zydus.ru

Кроме основных типов различают подтипы или квази-типы, от отдельного подтипа зависит течение заболевания и клинические проявления. Чувствительность вируса к применяемым схемам терапии зависит от генотипа и подтипа вируса.

Первый имеет три квази-типа a, b и c.
2 генотип вируса гепатита С разделяется на четыре формы – от a до d.
У третьего типа 6 подтипов – от a до f.
4 генотип имеет 10 квази-типов – от a до j.
Пятый и шестой генотипы гепатита С имеют только подтип a.

Как определить генотип гепатита С

Чтобы правильно определить тип вируса необходимо сдать анализ на генотип гепатита С. Он называется генотипирование вируса гепатита С.

Метод исследования – ПЦР (полимеразная цепная реакция) Real time. Этот метод позволяет произвести правильное определение генотипа гепатита с точностью более 97%.

Для диагностики генотипированием вируса гепатита С берется венозная кровь. Выявляется идентифицирующий участок РНК. В большинстве лабораторий при анализе на генотип гепатита С определяются самые распространенные квази-типы – 1,2 и 3.

Иногда генотип при проведении генотипирования HCV не определяется, такой результат проведенного анализа крови на генотип гепатита С не означает, что вируса нет. Такой исход можно объяснить двумя причинами:

нетипичный генотип для конкретного региона, необходим другой набор реагентов для проведения анализа на генотип вируса гепатита С;
низкие концентрации вирусных РНК в крови пациента, тогда нужна более мощная и чувствительная аппаратура для проведения генотипирования вируса гепатита С.

При комбинации двух типов вирусов в одном организме также осложняется проведение генотипирования HCV. Сдавать анализы лучше в крупных лабораториях, обладающих всем необходимым набором реактивов и современным оборудованием, тогда можно быть уверенным в результатах проведенных исследований.

Генотип с течением времени не может измениться, поэтому результат анализа действителен на протяжении всего курса лечения.

При проведении анализа на генотип гепатита С цена – это немаловажный фактор, в зависимости от региона она может варьироваться от 1200 до 2000 рублей. Это небольшая цена за уверенность в отсутствии или наличии определенного типа. Это крайне важно для назначения правильной схемы лечения, которая действительно поможет с 99% гарантией.

С появлением в 2013 году прямых противовирусных препаратов (ингибиторов обратной транскриптазы), ВОЗ и Европейской ассоциацией по изучению печени (EASL) были разработаны новые схемы лечения в зависимости от генотипа гепатита С. Выздоровление наступает в более 96% случаев.

После получения нового прямого противовирусного препарата Велпатасвира началась новая эра в лечение гепатита С. Комбинация Велпатасвира с Софосбувиром позволяет излечить пациентов даже без получения результата анализа крови на определение генотипа гепатита С. Перед пациентом и врачом уже не так остро стоит вопрос – как определить генотип гепатита С, как это было раньше до появления Велпатасвира. Но всё же генотипирование остается важным звеном диагностики и исключать его нельзя.

Для получения гарантированного положительного результата лечения необходимо не только пить назначаемые врачом препараты, но и соблюдать следующие ограничения:

не употреблять алкоголь, наркотические вещества;
хотя бы на время лечения нужно бросить курить;
не применять народные средства и гепатопротекторы;
максимально исключить любые нагрузки на печень – фаст-фуд, жирное, жареное, копченое.

Имеются клинически подтвержденные данные, что самолечение и алкогольная зависимость в большом проценте случаев приводят к циррозу. Кроме вирусной нагрузки пациент дополнительно разрушает печень этилом.

При сопутствующих заболеваниях, таких как: сахарный диабет, лишний вес, патологии щитовидной железы, индивидуальная непереносимость компонентов медикаментов, может потребоваться корректировка схем лечения. Все решения по изменению терапии может правильно принять только лечащий врач (вирусолог, гепатолог).

Генотип 1

До появления прямых противовирусных средств самым опасным генотипом гепатита С считался 1b. Он в большинстве случаев приводил к тяжелым поражениям печени – циррозу, печеночной недостаточности, тяжелой интоксикации, раку печени. Заболевание протекало очень тяжело и только половина больных полностью излечивались. Высокий риск возможности появления рецидивов.

Схема лечения гепатита С первого генотипа всех подтипов в зависимости от имеющихся дополнительных патологий выглядит следующим образом:

Источник