Вирус геном человека гепатита с
Вирус гепатита С и его геномВирус гепатита С (HCV) идентифицирован в 1989 году американскими исследователями под руководством М. Houghton, когда была выделена нуклеиновая кислота при экспериментальном заражении шимпанзе и в дальнейшем получена ДНК-копия, которую использовали для создания библиотеки клонов. Скрининг образцов из этой библиотеки позволил выявить клон, экспрессирующий антиген, который реагировал с антителами из сывороток людей, больных посттрансфузионным гепатитом ни А ни В. Далее был получен рекомбинантный белок, который содержал последовательность из 363 аминокислотных остатков вирусного белка. Эту последовательность обозначили как С-100-3 и использовали в качестве антигена при создании иммуноферментной тест-системы. Геном вируса гепатита С представлен однонитевой позитивной линейной молекулой РНК, состоящей из 9379 оснований и кодирующей полипротеин из ЗОН аминокислот, который под действием вирусных и клеточных протеаз нарезается на отдельные вирусные белки. Таксономический анализ выявил принадлежность вируса гепатита С к семейству Flaviviridae самостоятельному роду Hepacivirus. Вирус гепатита С относится к гепатотропным вирусам, но при этом доказана возможность его внепеченогной репликации, в частности в мононуклеарах крови. Весьма важным свойством этого вируса является способность ускользать из-под иммунного надзора «immune escape virus». В основе этой способности лежит перманентное и быстрое изменение антигенной структуры, в результате чего вирус воспроизводит себя не в каком-либо постоянном антигенном варианте, а целой серии близких, но в то же время иммунологически различных штаммов.
Одновременное существование вируса гепатита С в инфицированном организме в виде множества постоянно изменяющихся антигенных вариантов полугило наименование «quasispecies», то есть кажущихся разновидностей. В отличие от HBV механизм интеграции в геном хозяина вирусу гепатита С не присущ. Проведенный анализ нуклеотидных последовательностей изолятов вируса гепатита С различных частей его генома сделал возможным классификацию этого вируса. Наиболее удобной в настоящее время является номенклатура P. Simmonds et al, 1993, основанная на анализе последовательностей области NS5. Эта классификация, а также разработанная примерно в это же время система Н. Okamoto et al., 1992 стала общепринятой. К наиболее распространенным в мире генотипам вируса гепатита С относят: la, lb, 2а, 2b и 3а. Эти генотипы распространены в странах Западной Европы и в Америке, причем преобладающим является генотип lb. Совсем другое распределение генотипов HCV в странах центрального Востока и Северной и Центральной Африки. Генотип 4, главным образом 4а, доминирует в Египте, Йемене, Кувейте, Ираке, Саудовской Аравии, Заире, Бурунди, Габоне. На юге Африке наиболее часто встречается генотип 5а, который в других частях мира находили исключительно редко. Генотип 3 выявлен в странах Западной Европы, в Сингапуре, Таиланде, Мьянме и Восточной Индии. Всего выделено 9 подтипов третьего генотипа HCV. В России также проведены исследования по определению структуры генотипов ВГС, циркулирующих в различных ее регионах. Наиболее часто — 60-70 % случаев определен генотип HCV lb. Далее следуют генотипы За, 1а, и 2а. Так, в 1998 году Е. В. Лисицина во Владимирской области выявила следующую структуру генотипов HCV: lb — 72,9 %, 2а — 2,9 %, 2Ь — 2,9 % и За — 15,7 %. В 5,7 % случаев с имеющимся набором праймеров генотип определить не удалось. При этом было отмечено, что у лиц различного возраста структура генотипов различается. У лиц в возрасте 7-14 лет генотип It и За выявлен с одинаковой частотой —42,9%. Среди лиц старше 50 лет генотип lb выявлен в 90% случаев, тогда как За не определен вовсе. Особенности распространения отдельных генотипов позволили обозначить их по региону доминирующего распространения. Так, генотип 1а условно называют «американским», генотип lb —«японским». Превалирование генотипа HCV 2с в Италии и среди итальянцев, живущих в других странах, дали основания считать его «итальянским». Е. И. Самохвалов, С. Н. Кузин, С. О. Вязов, Д. К. Львов изучали «итальянский» генотип 2с вируса гепатита С на территории России. — Также рекомендуем «Белки и антигены вируса гепатита С. Диагностика ВГС» Оглавление темы «Диагностика вирусных гепатитов»:
|
Источник
Вирус гепатита C подразделяется на 8 генотипов, а те, в свою очередь, на свыше 100 подтипов.
Генотипы вируса гепатита С различаются между собой по вариабельности нуклеотидного уровня более чем на 30%; подтипы внутри генотипа вируса вариабельны между собой примерно на 15%.[1]
Все генотипы вируса способны приводить к циррозу и гепатоцеллюлярной карциноме, однако генотип 3 является фактором более быстрого прогрессирования заболевания.[2]
Географически наиболее распространены генотипы 1—4. В Северной Америке и Западной Европе наиболее распространён подтип 1a[3], охватывающий до 70% всех случаев. В Центральной и Восточной Европе наиболее распространён подтип 1b.
На просторах бывшего СССР наибольшее распространение получили подтип 1b и генотип 3.
Генотип 4 наиболее распространён на Ближнем Востоке и Африке: в Египте на него приходится до 90% всех инфекций.[4]
Наиболее сложны в лечении подтип 1a и генотип 3.
Из-за большого генетического разнообразия генотипа 2, часто вступающего в рекомбинанты с другими генотипами, встречаются отдельные штаммы генотипа 2, более устойчивые к терапии.
Самым проработанным для лечения является подтип 1b.
Согласно проведённому эволюционному анализу, ближайший общий предок вируса генотипа 3a существовал приблизительно 200 лет назад.[5]
| Генотипы | Подмножества | Географического распределения[6] |
|---|---|---|
| Генотип 1 | 1a, 1b… 1n — всего 13 поименованных и 7 безымянных подтипов | Северная Америка, Евразия, Центральная Африка |
| Генотип 2 | 2a, 2b… 2u — всего 15 поименованных и 8 безымянных подтипов | Западная Африка, Италия |
| Генотип 3 | 3a, 3b… 3k — всего 8 поименованных подтипов и 1 безымянный | Индостан, Юго-Восточная Азия, республики бывшего СССР |
| Генотип 4 | 4a, 4b… 4w — всего 18 поименованных и 10 безымянных подтипов | Центральная Африка, Египет |
| Генотип 5 | 5a | Южная Африка и Азия |
| Генотип 6 | 6a, 6b… 6xf — всего 29 поименованных подтипов и 21 безымянный | Юго-Восточная Азия |
| Генотип 7 | Демократическая республика Конго[7] | |
| Генотип 8 | Штат Пенджаб (Индия) | |
| Рекомбинантные генотипы | 1a/1c, 1b/1a, 2/5, 2b/1a, 2b/6w, 2k/1b, 4d/4a, 6n/6o и прочие[8] |
Методы определения[править | править код]
Основные методы, используемые для диагностики генотипа HCV, являются следующие:
- Иммуноферментный анализ
- Полимеразная цепная реакция в реальном времени
- Рекомбинантный иммуноблот анализ
Ссылки[править | править код]
- ↑ Identification of Novel HCV Genotype and Subtypes in Patients Treated with Sofosbuvir-Based Regimens. www.natap.org (8 ноября 2017). Дата обращения 10 ноября 2017.
- ↑ Генотип 3 гепатита С может являться фактором более быстрого прогрессирования фиброза печени. www.hv-info.ru (28 октября 2009). Дата обращения 10 ноября 2017.
- ↑ https://hepatitis-c.emedtv.com/hepatitis-c/hepatitis-c-genotypes.html[необходимо уточнить]
- ↑ Nouroz, Faisal. An overview on hepatitis C virus genotypes and its control (англ.) // Egyptian Journal of Medical Human Genetics : journal. — 2015. — Vol. 16, no. 4. — P. 291—298. — doi:10.1016/j.ejmhg.2015.05.003.
- ↑ Akkarathamrongsin S, Hacharoen P, Tangkijvanich P, et al. Molecular epidemiology and genetic history of hepatitis C virus subtype 3a infection in Thailand. Intervirology 2013; 56: 284–94.
- ↑ A new insight into hepatitis C vaccine development (англ.) // Journal of Biomedicine & Biotechnology (англ.)русск. : journal. — 2010. — Vol. 2010. — P. 548280. — doi:10.1155/2010/548280. — PMID 20625493.
- ↑ Donald G. Murphy, Erwin Sablon, Jasmine Chamberland, Eric Fournier, Raymond Dandavino. Hepatitis C Virus Genotype 7, a New Genotype Originating from Central Africa (англ.) // Journal of Clinical Microbiology. — 2015-03-01. — Vol. 53, iss. 3. — P. 967—972. — ISSN 1098-660X 0095-1137, 1098-660X. — doi:10.1128/JCM.02831-14.
- ↑ Andrea Galli, Jens Bukh. Comparative analysis of the molecular mechanisms of recombination in hepatitis C virus (англ.) // Trends in Microbiology. — Cell Press (англ.)русск., 2014-06-01. — Vol. 22, iss. 6. — P. 354—364. — ISSN 1878-4380 0966-842X, 1878-4380. — doi:10.1016/j.tim.2014.02.005.
Источник
Ежегодно вирус гепатита С, открытый в 1989 году, забирает жизни миллионов людей на нашей планете. Сегодня этот чрезвычайно коварный и опасный вирус ставят в один ряд с такими заболеваниями, как СПИД, сифилис и рак. И хотя современная медицина достигла значительных успехов в исследовании вируса, его этимологии и путей передачи, вакцина от гепатита С на сегодняшний день так и не была разработана, а лечение заболевания является очень трудным и дорогостоящим.
Возбудителем одной из самых страшных болезней в мире является вирус HCV, который отличается высокой изменчивостью и способностью к мутациям. Мало кто знает, что возбудитель HCV представляет собой целый комплекс вирусов, которые классифицируются по разным признакам.
Несмотря на то что в современной медицине уже открыто 11 генотипов гепатита С, Всемирная организация здравоохранения признает только 6 основных штаммов.
Какие бывают генотипы вируса гепатита С?
Генотипы – это типы вирусов, которые отличаются друг от друга набором генов. Они могут иметь свои подтипы (квази-типы), которые из-за своего неустойчивого генетического материала постоянно мутируют и видоизменяются.
Генотипы гепатита С условно обозначаются цифрами от 1 до 6, неравномерно распределяются по всему миру и имеют большое количество подтипов.
Распределение генотипов HCV в мире
Согласно статистическим данным, полученным ВОЗ из разных стран мира, генотипы 1-3 были зафиксированы во всех уголках нашей планеты, тогда как генотип 4 наибольшее распространение получил в Северной Америке, а генотип 6 – в Южной Африке.
Если говорить о возрастном распределении, то ученые отмечают, что у взрослых преимущественно встречается квази-тип 1в (52%), тогда как у детей он диагностируется только в 25% случаев. При этом генотипы 5 и 6 у детского населения вовсе не были выявлены.
Интересно, но в последние годы наблюдается тенденция к увеличению уровня распространения генотипа 2 и снижению уровня квази-типа 1в.
Приблизительно в 9% случаев в крови у больных диагностируется более одного вида вируса HCV. В таком случае говорят о смешанном генотипе гепатита С.
Особенности генотипов гепатита С
Генотип 1
Генотип 1 имеет подтипы a, b, c. Он встречается во всем мире, однако особенное распространение получил в странах бывшего СССР.
В России, Украине и Белоруссии наибольшее распространение получили подтипы 1а и 1b.
Главной особенностью генотипа 1 является то, что он очень трудно поддается лечению. Дело в том, что в отличие от других штаммов вируса первый генотип может легко приспосабливаться к новым условиям и методам лечения. Именно поэтому многие врачи, отвечая на вопрос, какой генотип гепатита С самый опасный, указывают на генотип 1.
Среди всех подвидов 1б является самым страшным, поскольку в 90% случаев он переходит в хроническую форму, которая грозит многочисленными осложнениями.
Как доказывает медицинская практика, едва ли не единственным действенным средством лечения является использование Интерферона с Рибавирином. Согласно статистическим данным, эффективность данной схемы лечения позволяет достичь положительного результата в 50% случаев. При этом длительность лечения квази-типов 1а и 1б составляет не менее 48 недель.
Успешность терапии зависит от таких факторов:
- Давность заболевания. Для пациентов, у которых давность заболевания составляет более пяти лет, прогноз неутешительный. В данном случае медикаментозное лечение проходит очень трудно, а его продолжительность значительно увеличивается.
- Количество вируса в крови. Чем меньше вирусная нагрузка на организм человека, тем успешнее проходит терапия.
- Соблюдение правильного образа жизни. Отказ от алкоголя и других вредных привычек, а также соблюдение правильного питания и диеты существенно повышают шансы на выздоровление.
Генотип 2
Имеет подтипы a, b, c. Он распространен во всем мире, однако в отличие от других генотипов встречается значительно реже, характеризуется низкой вирусной нагрузкой и медленным течением воспалительного процесса. В случае диагностирования генотипа 2 гепатита С осложнения наступают крайне редко, а выздоровление происходит в 90% случаев. Именно поэтому его нередко называют «щадящим».
Лечение осуществляется при помощи комбинированного приема Интерферона и Рибавирина. Также эффективность терапии наблюдается в случае использования препаратов прямого противовирусного действия – Софосбувира, Даклатасвира, Ледипасвира.
Генотип 2 – самый «щадящий» тип вируса HCV
Генотип 3
Имеет подтипы a и b. Он встречается во всем мире, однако наибольшее распространение имеет на территории стран бывшего СССР. Также зафиксировано немало случаев инфицирования на территории Австралии и Южной Азии.
Генотип 3 считается одним из самых изученных типов заболевания. Он достаточно хорошо поддается лечению: в 80% случаев при правильно подобранной медикаментозной терапии удается достичь желаемого эффекта. Длительность лечения составляет не менее 24-х недель.
Лечить гепатит С генотипа 3 можно с помощью противовирусных препаратов нового поколения. Исследования показывают, что наиболее эффективным является использование Рибофлавина в комплексе с Интерфероном. Также ученые отмечают, что квази-тип 3а хорошо поддается лечению такими препаратами, как Веро-Рибавирин и Интераль.
Если же генотип 3 гепатита С не лечить, возможно появление опасных осложнений. Прежде всего речь идет о таких осложнениях:
- Фиброз печени. Согласно данным исследований швейцарских ученых, фиброз печени чаще всего наблюдается у больных гепатитом с квази-типом 3а. И хотя на сегодняшний день не существует препаратов, с помощью которых можно полностью победить заболевание, при своевременном лечении патологические процессы в печени можно приостановить на долгие годы.
- Стеатоз. Замечено, что у пациентов с вирусным гепатитом С с генотипом 3 стеатоз развивается в 70% случаев.
Стеатоз печени – одно из самых распространенных осложнений, которое наблюдается у больных с вирусом HCV генотипа 3
Генотипы 4, 5, 6
Генотип 4 имеет наибольшее количество квази-типов (a, b, c, d, e, f, h, i, j) и чаще всего встречается в Северной Африке, преимущественно в Египте. Пятый и шестой генотипы имеют всего лишь по одному квази-типу – 5а и 6а. При этом если 5а преимущественно преобладает в ЮАР, то 6а – распространен в Азии.
Генотипы 4, 5, 6 являются малоизученными, однако известно, что инфицирование происходит через кровь или во время незащищенного полового акта.
Поскольку эффективная схема лечения гепатита С с генотипами 4, 5, 6 не разработана, используются традиционные препараты Интерферон и Рибавирин, а также дорогостоящие лекарственные средства прямого действия – Софосбувир, Даклатасвир, Ледипасвир.
Зачем нужно определять генотип?
Определение генотипа (генотипирование) – это один из самых важных анализов, которые используются для диагностики гепатита С.
Главными задачами генотипирования являются:
- определение схемы лечения, выбор препаратов, их дозировки;
- прогнозирование течения болезни и эффективности выбранной терапии;
- прогнозирование длительности лечения.
Генотипирование напрямую влияет на выбор схемы лечения заболевания
Современные медицинские технологии позволяют с максимальной точностью определить генотип гепатита С. Для этого используются полученные результаты исследований крови и плазмы.
Наиболее эффективными методами генотипирования гепатита С при исследованиях крови и плазмы больного являются:
- прямое секвенирование;
- полимеразная цепная реакция;
- обратная гибридизация с зондами на мембране.
Многие пациенты задают вопрос, где сдать анализ на генотип гепатита С. Если речь идет о распространенных генотипах 1-3, то сегодня подобные исследования проводят практически все местные лаборатории (Инвитро и т.д.). Если же генотип HCV не удалось узнать и необходимо дополнительно сдать кровь на специфические штаммы 4-6, исследования проводятся в специализированных центрах, которые расположены в крупных городах.
Лечение гепатита С индийскими препаратами
В начале ХХІ в. медицина сделала огромный прорыв в лечении гепатита С. Были открыты новые аналоги противовирусных препаратов – индийские дженерики, которые оказывают прямое действие на вирус HCV и способствуют полному излечению от вирусного гепатита С практически всех генотипов.
Среди таких препаратов – МайХеп, СовиХеп, Вирсо, Ледифос, Хепсинат-ЛП, Надтак.
Индийские препараты-дженерики – это аналоги дорогостоящих медицинских препаратов от гепатита С
Преимущественно отзывы об индийских препаратов позитивные. Вот что пишут на форумах в интернете.
Ольга, 38 лет
На протяжении многих лет гепатитом С болел мой отец. Испробовали много различных средств и препаратов, поскольку купить Софосбувир было не по карману. Поэтому индийские дженерики стали для нас спасением от цирроза, фиброза печени и других осложнений, которые, по словам врачей, уже были неизбежны. Использовали для лечения препарат Хепсинат-ЛП. Такое лечение оказалось достаточно эффективным, и уже через год отец был здоров, а анализы показали, что у него в крови вирус отсутствует.
Владислав, 56 лет
Пять лет назад у меня диагностировали вирусный гепатит С с генотипом 3b. В течение нескольких лет пробовал лечиться с помощью Интерферона и Рибавирина. Курс был очень дорогой, поэтому его забросил. На фоне гепатита С началось развитие фиброза печени. Год назад решил, что лучше лечиться самому, поэтому заказал индийский препарат Ледифос. Достать его оказалось несложно, да и результат удивил – вирус гепатита С был уничтожен, а фиброз печени удалось приостановить.
Татьяна, 50 лет
Несколько лет назад начали беспокоить сильные боли в области печени. Врачи диагностировали гепатит С. Услышав, сколько стоит лечение гепатита С, хотела опустить руки. Однако на интернет-форумах прочитала об индийских дженериках и решила попробовать. Среди всех известных препаратов выбрала Надтак. После полного курса лечения удалось полностью победить гепатит С. Однако хочу отметить, что препарата Надтак, впрочем, как и других индийских дженериков, нет в свободной продаже, поэтому пришлось его заказывать непосредственно из Индии. Побочные эффекты после приема препарата были незначительные (беспокоили головные боли, тошнота и чрезмерная сонливость).
Таким образом, определение генотипа гепатита С является необходимой мерой в лечении гепатита С, ведь именно от результатов генотипирования зависит выбор методов терапии, ее продолжительность и результат.
Источник
